RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455127.6

MCRIP1-201, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MCRIP1, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-201ENST00000455127 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.22■■■■■ 5.15
MCRIP1-201ENST00000455127 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.87■■■■■ 4.29
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCC9O60706 1549 aa40.77■■■■■ 4.12
MCRIP1-201ENST00000455127 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.43■■■■□ 3.9
MCRIP1-201ENST00000455127 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
MCRIP1-201ENST00000455127 NACADO15069 1562 aa39.32■■■■□ 3.88
MCRIP1-201ENST00000455127 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
MCRIP1-201ENST00000455127 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.14■■■■□ 3.86
MCRIP1-201ENST00000455127 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-201ENST00000455127 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.46■■■■□ 3.75
MCRIP1-201ENST00000455127 SCRIBQ14160 1630 aa38.24■■■■□ 3.71
MCRIP1-201ENST00000455127 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.17■■■■□ 3.72e-6■■□□□ 13.8
MCRIP1-201ENST00000455127 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.12■■■■□ 3.69
MCRIP1-201ENST00000455127 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.7■■■■□ 3.63
MCRIP1-201ENST00000455127 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.25■■■■□ 3.55
MCRIP1-201ENST00000455127 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
MCRIP1-201ENST00000455127 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.9■■■■□ 3.5
MCRIP1-201ENST00000455127 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
MCRIP1-201ENST00000455127 SMARCA4P51532 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
MCRIP1-201ENST00000455127 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
MCRIP1-201ENST00000455127 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.4■■■■□ 3.42
MCRIP1-201ENST00000455127 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.33■■■■□ 3.41
MCRIP1-201ENST00000455127 SMARCA2P51531 1590 aa36.31■■■■□ 3.4
MCRIP1-201ENST00000455127 NCAPD3P42695 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
MCRIP1-201ENST00000455127 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.22■■■■□ 3.39
MCRIP1-201ENST00000455127 HMGXB3Q12766 1538 aa36.11■■■■□ 3.37
MCRIP1-201ENST00000455127 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 WIZO95785 1651 aa36.03■■■■□ 3.36
MCRIP1-201ENST00000455127 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
MCRIP1-201ENST00000455127 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
MCRIP1-201ENST00000455127 NESP48681 1621 aa35.35■■■■□ 3.25
MCRIP1-201ENST00000455127 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.29■■■■□ 3.24
MCRIP1-201ENST00000455127 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.25■■■■□ 3.23
MCRIP1-201ENST00000455127 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.24■■■■□ 3.23
MCRIP1-201ENST00000455127 ERCC6Q03468 1493 aa35.13■■■■□ 3.21
MCRIP1-201ENST00000455127 CFTRP13569 1480 aa35.08■■■■□ 3.21
MCRIP1-201ENST00000455127 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
MCRIP1-201ENST00000455127 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.96■■■■□ 3.19
MCRIP1-201ENST00000455127 PRDM2Q13029 1718 aa34.85■■■■□ 3.17
MCRIP1-201ENST00000455127 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.84■■■■□ 3.17
MCRIP1-201ENST00000455127 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.77■■■■□ 3.16
MCRIP1-201ENST00000455127 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
MCRIP1-201ENST00000455127 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.67■■■■□ 3.14
MCRIP1-201ENST00000455127 CUX2O14529 1486 aa34.65■■■■□ 3.14
MCRIP1-201ENST00000455127 WDR62O43379 1518 aa34.55■■■■□ 3.12
MCRIP1-201ENST00000455127 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCC8Q09428 1581 aa34.32■■■■□ 3.09
MCRIP1-201ENST00000455127 TOPBP1Q92547 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
MCRIP1-201ENST00000455127 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.28■■■■□ 3.08
MCRIP1-201ENST00000455127 CUX1P39880 1505 aa34.13■■■■□ 3.05
MCRIP1-201ENST00000455127 IFT140Q96RY7 1462 aa34.03■■■■□ 3.04
MCRIP1-201ENST00000455127 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
MCRIP1-201ENST00000455127 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34■■■■□ 3.03
MCRIP1-201ENST00000455127 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.98■■■■□ 3.03
MCRIP1-201ENST00000455127 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 SOGA1O94964 1423 aa33.91■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 TOP2BQ02880 1626 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 SYNJ1O43426 1573 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.9■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.89■■■■□ 3.02
MCRIP1-201ENST00000455127 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
MCRIP1-201ENST00000455127 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
MCRIP1-201ENST00000455127 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.993e-6■■■□□ 17.5
MCRIP1-201ENST00000455127 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 WDR97A6NE52 1622 aa33.68■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.66■■■□□ 2.98
MCRIP1-201ENST00000455127 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.51■■■□□ 2.96
MCRIP1-201ENST00000455127 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.5■■■□□ 2.95
MCRIP1-201ENST00000455127 GRIN2BQ13224 1484 aa33.47■■■□□ 2.95
MCRIP1-201ENST00000455127 PBRM1Q86U86 1689 aa33.44■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.39■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 TRIM41Q8WV44 630 aa33.39■■■□□ 2.94
MCRIP1-201ENST00000455127 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.37■■■□□ 2.93
MCRIP1-201ENST00000455127 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
MCRIP1-201ENST00000455127 OSCARQ8IYS5 282 aa33.31■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 FBLN2P98095 1184 aa33.3■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 CHD1O14646 1710 aa33.3■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 KIF27Q86VH2 1401 aa33.28■■■□□ 2.92
MCRIP1-201ENST00000455127 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.26■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 SYNJ2O15056 1496 aa33.23■■■□□ 2.91
MCRIP1-201ENST00000455127 ADAMTS12P58397 1594 aa33.16■■■□□ 2.9
MCRIP1-201ENST00000455127 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.13■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.13■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 IGF1RP08069 1367 aa33.12■■■□□ 2.89
MCRIP1-201ENST00000455127 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.06■■■□□ 2.88
MCRIP1-201ENST00000455127 GRIN2AQ12879 1464 aa33.04■■■□□ 2.88
MCRIP1-201ENST00000455127 CUL7Q14999 1698 aa33.01■■■□□ 2.87
MCRIP1-201ENST00000455127 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.93■■■□□ 2.86
MCRIP1-201ENST00000455127 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.9■■■□□ 2.86
MCRIP1-201ENST00000455127 NUP160Q12769 1436 aa32.87■■■□□ 2.85
MCRIP1-201ENST00000455127 CEP170Q5SW79 1584 aa32.87■■■□□ 2.85
MCRIP1-201ENST00000455127 EEA1Q15075 1411 aa32.77■■■□□ 2.84
MCRIP1-201ENST00000455127 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.75■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.74■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 ARHGEF11O15085 1522 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
MCRIP1-201ENST00000455127 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms