RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426925.5

SH3BP5-206, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BP5, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-206ENST00000426925 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.16■■■□□ 2.74
SH3BP5-206ENST00000426925 HRCP23327 699 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-206ENST00000426925 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5-206ENST00000426925 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5-206ENST00000426925 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP5-206ENST00000426925 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP5-206ENST00000426925 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5-206ENST00000426925 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-206ENST00000426925 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-206ENST00000426925 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-206ENST00000426925 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5-206ENST00000426925 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SH3BP5-206ENST00000426925 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP5-206ENST00000426925 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-206ENST00000426925 MYT1Q01538 1121 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5-206ENST00000426925 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SH3BP5-206ENST00000426925 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-206ENST00000426925 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BP5-206ENST00000426925 ABCC9O60706 1549 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5-206ENST00000426925 TRIM41Q8WV44 630 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP5-206ENST00000426925 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-206ENST00000426925 NEUROD1Q13562 356 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-206ENST00000426925 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-206ENST00000426925 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5-206ENST00000426925 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP5-206ENST00000426925 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP5-206ENST00000426925 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5-206ENST00000426925 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
SH3BP5-206ENST00000426925 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP5-206ENST00000426925 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-206ENST00000426925 SCRIBQ14160 1630 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-206ENST00000426925 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-206ENST00000426925 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-206ENST00000426925 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-206ENST00000426925 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-206ENST00000426925 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-206ENST00000426925 CEP162Q5TB80 1403 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5-206ENST00000426925 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5-206ENST00000426925 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-206ENST00000426925 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-206ENST00000426925 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SH3BP5-206ENST00000426925 MIER1Q8N108 512 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-206ENST00000426925 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-206ENST00000426925 WIZO95785 1651 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-206ENST00000426925 EEA1Q15075 1411 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-206ENST00000426925 NACADO15069 1562 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-206ENST00000426925 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-206ENST00000426925 GOLGA3Q08378 1498 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-206ENST00000426925 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP5-206ENST00000426925 ABCC8Q09428 1581 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP5-206ENST00000426925 SOGA1O94964 1423 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP5-206ENST00000426925 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP5-206ENST00000426925 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP5-206ENST00000426925 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP5-206ENST00000426925 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5-206ENST00000426925 SMARCA2P51531 1590 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-206ENST00000426925 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5-206ENST00000426925 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5-206ENST00000426925 KIF21BO75037 1637 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-206ENST00000426925 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-206ENST00000426925 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5-206ENST00000426925 APLP2Q06481 763 aa24.33■■□□□ 1.48
SH3BP5-206ENST00000426925 CLIP1P30622 1438 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5-206ENST00000426925 SMARCA4P51532 1647 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-206ENST00000426925 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-206ENST00000426925 BCL11AQ9H165 835 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-206ENST00000426925 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-206ENST00000426925 CUX2O14529 1486 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5-206ENST00000426925 SYNJ1O43426 1573 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-206ENST00000426925 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5-206ENST00000426925 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5-206ENST00000426925 NEFLP07196 543 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP5-206ENST00000426925 FKBP8Q14318 412 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP5-206ENST00000426925 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SH3BP5-206ENST00000426925 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP5-206ENST00000426925 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5-206ENST00000426925 BCANQ96GW7 911 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-206ENST00000426925 ARAP1Q96P48 1450 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-206ENST00000426925 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.77■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 CCER2I3L3R5 266 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 KCNH8Q96L42 1107 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 PRXQ9BXM0 1461 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-206ENST00000426925 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5-206ENST00000426925 TOP2BQ02880 1626 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5-206ENST00000426925 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-206ENST00000426925 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-206ENST00000426925 MAPKBP1O60336 1514 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-206ENST00000426925 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-206ENST00000426925 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-206ENST00000426925 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-206ENST00000426925 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5-206ENST00000426925 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-206ENST00000426925 ANP32CO43423 234 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP5-206ENST00000426925 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-206ENST00000426925 MAP3K1Q13233 1512 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-206ENST00000426925 MSH5O43196 834 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms