RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319073.5

RNF170-202, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RNF170, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-202ENST00000319073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.33■■■□□ 2.29
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RNF170-202ENST00000319073 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RNF170-202ENST00000319073 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.35■■□□□ 1.97
RNF170-202ENST00000319073 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.91■■□□□ 1.9
RNF170-202ENST00000319073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.13■■□□□ 1.77
RNF170-202ENST00000319073 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.97■■□□□ 1.75
RNF170-202ENST00000319073 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.96■■□□□ 1.75
RNF170-202ENST00000319073 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
RNF170-202ENST00000319073 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.71■■□□□ 1.71
RNF170-202ENST00000319073 NACADO15069 1562 aa25.67■■□□□ 1.7
RNF170-202ENST00000319073 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.51■■□□□ 1.67
RNF170-202ENST00000319073 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.32■■□□□ 1.64
RNF170-202ENST00000319073 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.27■■□□□ 1.64
RNF170-202ENST00000319073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-202ENST00000319073 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
RNF170-202ENST00000319073 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
RNF170-202ENST00000319073 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RNF170-202ENST00000319073 CUX2O14529 1486 aa24.64■■□□□ 1.53
RNF170-202ENST00000319073 SCRIBQ14160 1630 aa24.36■■□□□ 1.49
RNF170-202ENST00000319073 TRIM41Q8WV44 630 aa24.2■■□□□ 1.46
RNF170-202ENST00000319073 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.2■■□□□ 1.46
RNF170-202ENST00000319073 ERCC6Q03468 1493 aa24.17■■□□□ 1.46
RNF170-202ENST00000319073 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RNF170-202ENST00000319073 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
RNF170-202ENST00000319073 NESP48681 1621 aa23.72■■□□□ 1.39
RNF170-202ENST00000319073 NCAPD3P42695 1498 aa23.71■■□□□ 1.39
RNF170-202ENST00000319073 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-202ENST00000319073 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-202ENST00000319073 SMARCA2P51531 1590 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-202ENST00000319073 HMGXB3Q12766 1538 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-202ENST00000319073 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF170-202ENST00000319073 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
RNF170-202ENST00000319073 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RNF170-202ENST00000319073 OSCARQ8IYS5 282 aa23.21■■□□□ 1.31
RNF170-202ENST00000319073 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 SMARCA4P51532 1647 aa23.16■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 WDR62O43379 1518 aa23.15■■□□□ 1.3
RNF170-202ENST00000319073 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RNF170-202ENST00000319073 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RNF170-202ENST00000319073 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.11■■□□□ 1.29
RNF170-202ENST00000319073 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.99■■□□□ 1.27
RNF170-202ENST00000319073 ARHGEF11O15085 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF170-202ENST00000319073 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-202ENST00000319073 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RNF170-202ENST00000319073 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.76■■□□□ 1.23
RNF170-202ENST00000319073 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.73■■□□□ 1.23
RNF170-202ENST00000319073 ARAP1Q96P48 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
RNF170-202ENST00000319073 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.64■■□□□ 1.21
RNF170-202ENST00000319073 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
RNF170-202ENST00000319073 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RNF170-202ENST00000319073 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RNF170-202ENST00000319073 CHD1O14646 1710 aa22.42■■□□□ 1.18
RNF170-202ENST00000319073 CFTRP13569 1480 aa22.41■■□□□ 1.18
RNF170-202ENST00000319073 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RNF170-202ENST00000319073 IFT140Q96RY7 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
RNF170-202ENST00000319073 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RNF170-202ENST00000319073 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RNF170-202ENST00000319073 WIZO95785 1651 aa22.29■■□□□ 1.16
RNF170-202ENST00000319073 PRDM2Q13029 1718 aa22.2■■□□□ 1.14
RNF170-202ENST00000319073 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.12■■□□□ 1.13
RNF170-202ENST00000319073 TOPBP1Q92547 1522 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF170-202ENST00000319073 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
RNF170-202ENST00000319073 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RNF170-202ENST00000319073 FBLN2P98095 1184 aa22.04■■□□□ 1.12
RNF170-202ENST00000319073 ABCC8Q09428 1581 aa21.93■■□□□ 1.1
RNF170-202ENST00000319073 SYNJ1O43426 1573 aa21.92■■□□□ 1.1
RNF170-202ENST00000319073 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.91■■□□□ 1.1
RNF170-202ENST00000319073 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
RNF170-202ENST00000319073 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.88■■□□□ 1.09
RNF170-202ENST00000319073 FOXD1Q16676 465 aa21.88■■□□□ 1.09
RNF170-202ENST00000319073 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RNF170-202ENST00000319073 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.83■■□□□ 1.09
RNF170-202ENST00000319073 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.83■■□□□ 1.08
RNF170-202ENST00000319073 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RNF170-202ENST00000319073 WDR97A6NE52 1622 aa21.73■■□□□ 1.07
RNF170-202ENST00000319073 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RNF170-202ENST00000319073 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RNF170-202ENST00000319073 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RNF170-202ENST00000319073 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.71■■□□□ 1.07
RNF170-202ENST00000319073 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.68■■□□□ 1.06
RNF170-202ENST00000319073 SYNJ2O15056 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
RNF170-202ENST00000319073 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.63■■□□□ 1.05
RNF170-202ENST00000319073 SOGA1O94964 1423 aa21.61■■□□□ 1.05
RNF170-202ENST00000319073 GRIN2BQ13224 1484 aa21.58■■□□□ 1.05
RNF170-202ENST00000319073 PBRM1Q86U86 1689 aa21.53■■□□□ 1.04
RNF170-202ENST00000319073 KDM6BO15054 1643 aa21.52■■□□□ 1.04
RNF170-202ENST00000319073 CEP170Q5SW79 1584 aa21.49■■□□□ 1.03
RNF170-202ENST00000319073 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.49■■□□□ 1.03
RNF170-202ENST00000319073 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF170-202ENST00000319073 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.46■■□□□ 1.03
RNF170-202ENST00000319073 SHROOM2Q13796 1616 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-202ENST00000319073 DIP2BQ9P265 1576 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-202ENST00000319073 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-202ENST00000319073 FBXO41Q8TF61 875 aa21.38■■□□□ 1.01
RNF170-202ENST00000319073 MAPKBP1O60336 1514 aa21.36■■□□□ 1.01
RNF170-202ENST00000319073 ADGRL1O94910 1474 aa21.36■■□□□ 1.01
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