RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
SMIM4-201ENST00000307106 ABCC9O60706 1549 aa28.24■■■□□ 2.11
SMIM4-201ENST00000307106 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.8■■■□□ 2.04
SMIM4-201ENST00000307106 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.93■■□□□ 1.9
SMIM4-201ENST00000307106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.67■■□□□ 1.86
SMIM4-201ENST00000307106 NACADO15069 1562 aa26.33■■□□□ 1.81
SMIM4-201ENST00000307106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.25■■□□□ 1.79
SMIM4-201ENST00000307106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
SMIM4-201ENST00000307106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.99■■□□□ 1.75
SMIM4-201ENST00000307106 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.92■■□□□ 1.74
SMIM4-201ENST00000307106 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.74■■□□□ 1.71
SMIM4-201ENST00000307106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.55■■□□□ 1.68
SMIM4-201ENST00000307106 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.49■■□□□ 1.67
SMIM4-201ENST00000307106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM4-201ENST00000307106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SMIM4-201ENST00000307106 SCRIBQ14160 1630 aa25.25■■□□□ 1.63
SMIM4-201ENST00000307106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.22■■□□□ 1.63
SMIM4-201ENST00000307106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SMIM4-201ENST00000307106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.16■■□□□ 1.62
SMIM4-201ENST00000307106 CUX2O14529 1486 aa24.58■■□□□ 1.52
SMIM4-201ENST00000307106 ERCC6Q03468 1493 aa24.43■■□□□ 1.5
SMIM4-201ENST00000307106 NCAPD3P42695 1498 aa24.26■■□□□ 1.47
SMIM4-201ENST00000307106 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM4-201ENST00000307106 NESP48681 1621 aa24.1■■□□□ 1.45
SMIM4-201ENST00000307106 HMGXB3Q12766 1538 aa24.09■■□□□ 1.45
SMIM4-201ENST00000307106 SMARCA2P51531 1590 aa24.06■■□□□ 1.44
SMIM4-201ENST00000307106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SMIM4-201ENST00000307106 SMARCA4P51532 1647 aa24.02■■□□□ 1.44
SMIM4-201ENST00000307106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.9■■□□□ 1.42
SMIM4-201ENST00000307106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.89■■□□□ 1.41
SMIM4-201ENST00000307106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SMIM4-201ENST00000307106 TRIM41Q8WV44 630 aa23.84■■□□□ 1.41
SMIM4-201ENST00000307106 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SMIM4-201ENST00000307106 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.78■■□□□ 1.4
SMIM4-201ENST00000307106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.69■■□□□ 1.38
SMIM4-201ENST00000307106 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM4-201ENST00000307106 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.55■■□□□ 1.36
SMIM4-201ENST00000307106 WDR62O43379 1518 aa23.54■■□□□ 1.36
SMIM4-201ENST00000307106 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM4-201ENST00000307106 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
SMIM4-201ENST00000307106 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
SMIM4-201ENST00000307106 OSCARQ8IYS5 282 aa23.3■■□□□ 1.32
SMIM4-201ENST00000307106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.25■■□□□ 1.31
SMIM4-201ENST00000307106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
SMIM4-201ENST00000307106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
SMIM4-201ENST00000307106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
SMIM4-201ENST00000307106 CFTRP13569 1480 aa23.11■■□□□ 1.29
SMIM4-201ENST00000307106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMIM4-201ENST00000307106 PRDM2Q13029 1718 aa23.08■■□□□ 1.29
SMIM4-201ENST00000307106 ARHGEF11O15085 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
SMIM4-201ENST00000307106 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SMIM4-201ENST00000307106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SMIM4-201ENST00000307106 IFT140Q96RY7 1462 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM4-201ENST00000307106 CHD1O14646 1710 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM4-201ENST00000307106 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SMIM4-201ENST00000307106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-201ENST00000307106 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SMIM4-201ENST00000307106 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
SMIM4-201ENST00000307106 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SMIM4-201ENST00000307106 ARAP1Q96P48 1450 aa22.73■■□□□ 1.23
SMIM4-201ENST00000307106 ABCC8Q09428 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
SMIM4-201ENST00000307106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.66■■□□□ 1.22
SMIM4-201ENST00000307106 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SMIM4-201ENST00000307106 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.63■■□□□ 1.21
SMIM4-201ENST00000307106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
SMIM4-201ENST00000307106 FBLN2P98095 1184 aa22.56■■□□□ 1.2
SMIM4-201ENST00000307106 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SMIM4-201ENST00000307106 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SMIM4-201ENST00000307106 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.46■■□□□ 1.19
SMIM4-201ENST00000307106 SYNJ1O43426 1573 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM4-201ENST00000307106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.41■■□□□ 1.18
SMIM4-201ENST00000307106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM4-201ENST00000307106 WDR97A6NE52 1622 aa22.39■■□□□ 1.17
SMIM4-201ENST00000307106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SMIM4-201ENST00000307106 SOGA1O94964 1423 aa22.34■■□□□ 1.17
SMIM4-201ENST00000307106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SMIM4-201ENST00000307106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-201ENST00000307106 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-201ENST00000307106 PBRM1Q86U86 1689 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM4-201ENST00000307106 SYNJ2O15056 1496 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-201ENST00000307106 GRIN2BQ13224 1484 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-201ENST00000307106 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-201ENST00000307106 CUX1P39880 1505 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-201ENST00000307106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.08■■□□□ 1.12
SMIM4-201ENST00000307106 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-201ENST00000307106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-201ENST00000307106 CEP170Q5SW79 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-201ENST00000307106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
SMIM4-201ENST00000307106 GRIN2AQ12879 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-201ENST00000307106 SHROOM2Q13796 1616 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-201ENST00000307106 ADAMTS12P58397 1594 aa21.93■■□□□ 1.1
SMIM4-201ENST00000307106 NUP160Q12769 1436 aa21.89■■□□□ 1.1
SMIM4-201ENST00000307106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.76■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.73■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 TSPOAP1O95153 1857 aa21.72■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.71■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 DIP2BQ9P265 1576 aa21.71■■□□□ 1.07
SMIM4-201ENST00000307106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.7■■□□□ 1.07
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