RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	GIS4	Q04233	774 aa		12.31	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	YPR148C	Q06523	435 aa		12.31	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	ALG1	P16661	449 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	SAS3	P34218	831 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	SPT21	P35209	758 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	PEX21	P50091	288 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	RSC1	P53236	928 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	LCD1	Q04377	747 aa		12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	GPA1	P08539	472 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	RKM3	P38222	552 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	NPR3	P38742	1146 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	VHR2	P40041	505 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	ASE1	P50275	885 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	GIN4	Q12263	1142 aa		12.29	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	YER130C	P39959	443 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	CSM3	Q04659	317 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	MMR1	Q06324	491 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	PTC5	Q12511	572 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	TRS33	Q99394	268 aa		12.28	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	OCT1	P35999	772 aa		12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	PER1	P25625	357 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	LYS14	P40971	790 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	DAK2	P43550	591 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	TRS120	Q04183	1289 aa		12.26	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	RRM3	P38766	723 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	SGD1	Q06132	899 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	SUE1	Q06524	206 aa		12.25	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	RAD18	P10862	487 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	PAN5	P38787	379 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	VAB2	P40003	282 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	YIL089W	P40500	205 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	DSE4	P53753	1117 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	YML037C	Q03703	340 aa		12.24	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	FMS1	P50264	508 aa		12.23	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	FOB1	O13329	566 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	PNT1	P38969	423 aa		12.22	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	FBP1	P09201	348 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	ATE1	P16639	503 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	GSY2	P27472	705 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	MRPL10	P36520	322 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	THI6	P41835	540 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	CIT3	P43635	486 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	YJL007C	P47080	104 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	YGR153W	P48238	217 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDR2	YOL052C-A	HIR1	P32479	840 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ATG32	P40458	529 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	NET1	P47035	1189 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	UGA4	P32837	571 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	MIC60	P36112	540 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.19	□□□□□ -0.46	not detected
DDR2	YOL052C-A	SUL1	P38359	859 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	VTC2	P43585	828 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	CKA2	P19454	339 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	TGL1	P34163	548 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	YKR018C	P36114	725 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	UBA2	P52488	636 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	LIF1	P53150	421 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	MFM1	Q02783	413 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	PEX29	Q03370	554 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	UBX5	Q06682	500 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	GUD1	Q07729	489 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	CDC15	P27636	974 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ISW1	P38144	1129 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	ORC6	P38826	435 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	AIM33	Q04516	312 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDR2	YOL052C-A	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64 ms