RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MAD1	P40957	749 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TAF8	Q03750	510 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	KAR5	Q04746	504 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TAF13	P11747	167 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	FUI1	P38196	639 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	ITC1	P53125	1264 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	ALD3	P54114	506 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	CLN2	P20438	545 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TFC3	P34111	1160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	UBP12	P39538	1254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	YJR107W	P47145	328 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	YJR142W	P47173	342 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	DAL5	P15365	543 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MRC1	P25588	1096 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	NTH2	P35172	780 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	CAB3	P36076	571 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MSC7	P38694	644 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	RCM1	P53972	490 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	WHI5	Q12416	295 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	PPH3	P32345	308 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MAC1	P35192	417 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
KTR2	YKR061W	YEN1	P40028	759 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	BUD6	P41697	788 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TLG1	Q03322	224 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	MCA1	Q08601	432 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TSC13	Q99190	310 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	SPE2	P21182	396 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
KTR2	YKR061W	NFU1	P32860	256 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KTR2	YKR061W	SWI3	P32591	825 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	JNM1	P36224	373 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MAL31	P38156	614 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MDJ2	P42834	146 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	DAK2	P43550	591 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ECM23	Q02710	187 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ATG16	Q03818	150 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SPO20	Q04359	397 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MRX10	Q05648	414 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PIN2	Q12057	282 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MNL2	Q12205	849 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ENT1	Q12518	454 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MLF3	P32047	452 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MUM2	P38236	366 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PRY1	P47032	299 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ATG1	P53104	897 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	VPS16	Q03308	798 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	RMD1	Q03441	430 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	CYT1	P07143	309 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SCD5	P34758	872 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ALG14	P38242	237 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SKP1	P52286	194 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	YGR021W	P53212	290 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	YNL165W	P53891	406 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	BDF2	Q07442	638 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PSK1	P31374	1356 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	MTC2	P34246	357 aa		5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	BUD9	P53226	547 aa		5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	SRM1	P21827	482 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	UBP1	P25037	809 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	RAD27	P26793	382 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	UBX7	P38349	436 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	NUP82	P40368	713 aa		5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
KTR2	YKR061W	FOL1	P53848	824 aa		5.11	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.8 ms