RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RTA1	P53047	317 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
YMR31	YFR049W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
YMR31	YFR049W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	MSH2	P25847	964 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	MKK2	P32491	506 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YKL107W	P34251	309 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	EXO5	P38289	585 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	CCC2	P38995	1004 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	NEO1	P40527	1151 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	FET4	P40988	552 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	LSB6	P42951	607 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YNR063W	P53749	607 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	FOL1	P53848	824 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UBP2	Q01476	1272 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TFB2	Q02939	513 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TAF8	Q03750	510 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	PEX6	P33760	1030 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	ADD66	P36040	267 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	BET3	P36149	193 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	RDH54	P38086	958 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TPM2	P40414	161 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	SLS1	P42900	643 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	ENT3	P47160	408 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YNR065C	P53751	1116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	AOS1	Q06624	347 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	RKM4	Q12504	494 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	NUP145	P49687	1317 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	CDC11	P32458	415 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TFA2	P36145	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YBR284W	P38150	797 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	DSS1	P39112	969 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	CNN1	P43618	361 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	YGR237C	P50089	785 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	HEH2	Q03281	663 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UGO1	Q03327	502 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	ATG13	Q06628	738 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	GIC2	Q06648	383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YMR31	YFR049W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
YMR31	YFR049W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NEM1	P38757	446 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PAN5	P38787	379 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	GDH3	P39708	457 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TPO2	P53283	614 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YLR346C	Q06139	101 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YDR306C	Q06640	478 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YPL066W	Q12194	479 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MRP10	O75012	95 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TOP3	P13099	656 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	FPS1	P23900	669 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MRC1	P25588	1096 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	MLS1	P30952	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	ALG3	P38179	458 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	OSH7	P38755	437 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PMT3	P47190	753 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
YMR31	YFR049W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	YPR071W	Q12346	211 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	TMA17	Q12513	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NFS1	P25374	497 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PPH3	P32345	308 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	DOM34	P33309	386 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	NIT1	P40447	199 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	PRK1	P40494	810 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SPO74	P45819	413 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	HNT2	P49775	206 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YMR31	YFR049W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87

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