RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W LYP1P32487 611 aa6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W REI1P38344 393 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W DSE4P53753 1117 aa6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W FAR11P53917 953 aa6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W NSE3Q05541 303 aa6.31□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W AFG2P32794 780 aa6.3□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W MAE1P36013 669 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W YLL054CQ12244 843 aa6.3□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SSK2P53599 1579 aa6.3□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W AGP1P25376 633 aa6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SIN3P22579 1536 aa6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W BAS1P22035 811 aa6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SYP1P25623 870 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SEA4P38164 1038 aa6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W SPO74P45819 413 aa6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W DED1P06634 604 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W BDF2Q07442 638 aa6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W UFD4P33202 1483 aa6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W AI1P03875 834 aa6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
PRD1YCL057W TRK2P28584 889 aa6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W RRM3P38766 723 aa6.28□□□□□ -1.4
PRD1YCL057W DBP5P20449 482 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W CNN1P43618 361 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YGR045CP53229 120 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W RPN4Q03465 531 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SHE9Q04172 456 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SPO20Q04359 397 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YMR074CQ04773 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SBA1P28707 216 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YAR028WP39548 234 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W BOI2P39969 1040 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YFL066CP43538 392 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W NCE103P53615 221 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ESC2Q06340 456 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YOR223WQ12015 292 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W STE5P32917 917 aa6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W MPH1P40562 993 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ESP1Q03018 1630 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W RAD4P14736 754 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ALG3P38179 458 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W BUD6P41697 788 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W LAP2Q10740 671 aa6.25□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W TRM732Q03496 1420 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W STU1P38198 1513 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W INO1P11986 533 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SFA1P32771 386 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W BUD9P53226 547 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YNR014WP53719 212 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YNR063WP53749 607 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W AOS1Q06624 347 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W AVO1Q08236 1176 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YPL066WQ12194 479 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W RKM4Q12504 494 aa6.24□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W VBA5P36172 582 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ATG14P38270 344 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W HUL5P53119 910 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YPL062WQ02781 134 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W SWR1Q05471 1514 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W RGD1P38339 666 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W VPS53P47061 822 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W PTC5Q12511 572 aa6.23□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W BPT1P14772 1559 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W MRP8P35719 219 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W YBR184WP38299 523 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W IRR1P40541 1150 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W GAS5Q08193 484 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W CIT2P08679 460 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W HSE1P38753 452 aa6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRD1YCL057W AI3P03877 415 aa6.21□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data6.21□□□□□ -1.42not detected
PRD1YCL057W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.21□□□□□ -1.42not detected
PRD1YCL057W HNT2P49775 206 aa6.21□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W TDA6Q06466 467 aa6.21□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W PPM2Q08282 695 aa6.21□□□□□ -1.42
PRD1YCL057W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms