RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-208ENST00000615445 TNRQ92752 1358 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-208ENST00000615445 CEP89Q96ST8 783 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 PIP4K2BP78356 416 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL34Q8N239 644 aa24.7■■□□□ 1.54
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PTPRJ-208ENST00000615445 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.68■■□□□ 1.54
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PTPRJ-208ENST00000615445 STK38Q15208 465 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-208ENST00000615445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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PTPRJ-208ENST00000615445 KRT32Q14532 448 aa24.58■■□□□ 1.53
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PTPRJ-208ENST00000615445 HYPKQ9NX55 129 aa24.58■■□□□ 1.53
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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PTPRJ-208ENST00000615445 A0A087WZG4 1122 aa24.54■■□□□ 1.52
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PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNA2Q15822 529 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ME1P48163 572 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 JMYQ8N9B5 988 aa24.54■■□□□ 1.52
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