RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR70Q9NW82 654 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 DRC1Q96MC2 740 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SIL1Q9H173 461 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ATF3P18847 181 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 GNAI2P04899 355 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.7■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 VPS36Q86VN1 386 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 TDO2P48775 406 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 FERMT2Q96AC1 680 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 TMX1Q9H3N1 280 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF18AQ8NI77 898 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 CTR9Q6PD62 1173 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 GNAI3P08754 354 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 TNIP1Q15025 636 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 FSD2A1L4K1 749 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN12O43309 604 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 MIA2Q96PC5 1412 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRJ-207ENST00000613246 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRJ-207ENST00000613246 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRJ-207ENST00000613246 FBF1Q8TES7 1133 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 MYL6BP14649 208 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPRJ-207ENST00000613246 ABCC8Q09428 1581 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMC4P43686 418 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 ESPNB1AK53 854 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC6Q16204 474 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP58Q5T655 872 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRJ-207ENST00000613246 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
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