RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.95■■□□□ 1.1
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.95■■□□□ 1.1
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HOXC9P31274 260 aa21.84■■□□□ 1.09
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1W2PP64 1363 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AK7Q96M32 723 aa21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C5P01031 1676 aa21.81■■□□□ 1.08
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.79■■□□□ 1.08
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBLN1P23142 703 aa21.76■■□□□ 1.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NBPF4Q96M43 638 aa21.76■■□□□ 1.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.69■■□□□ 1.06
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.63■■□□□ 1.05
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP6V1AP38606 617 aa21.6■■□□□ 1.05
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0G2JLW4 131 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FYB1O15117 783 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLRG1Q96E93 195 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPG7Q9UQ90 795 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FCHSD2O94868 740 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WDR90Q96KV7 1748 aa21.58■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITGB4P16144 1822 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMF1P82094 1093 aa21.55■■□□□ 1.04
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