RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 BECN1Q14457 450 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 G2E3Q7L622 706 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-205ENST00000587860 SLC4A2P04920 1241 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 ZNF428Q96B54 188 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.83■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 DLC1Q96QB1 1528 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 EYA1Q99502 592 aa18.81■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 MEIS3Q99687 375 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.8■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 ABTB2Q8N961 1025 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.78■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 USP6P35125 1406 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-205ENST00000587860 ABCC4O15439 1325 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 CHL1O00533 1208 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 REREQ9P2R6 1566 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 SIRT1Q96EB6 747 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 TECPR2O15040 1411 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 MSH6P52701 1360 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-205ENST00000587860 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 ANXA1P04083 346 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 GCC1Q96CN9 775 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 TBX22Q9Y458 520 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 PTCH1Q13635 1447 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 HSCBQ8IWL3 235 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 PEAK1Q9H792 1746 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 CEP85Q6P2H3 762 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 C3P01024 1663 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 HOXC9P31274 260 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 IL17REQ8NFR9 667 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 PIK3R4Q99570 1358 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 ITSN1Q15811 1721 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 KIF2CQ99661 725 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 KCNQ3O43525 872 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 LGR6Q9HBX8 967 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-205ENST00000587860 DCTPP1Q9H773 170 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 FLT4P35916 1363 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 ORAI2Q96SN7 254 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 CRB1P82279 1406 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 RGS12O14924 1447 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 PSME1Q06323 249 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 CLCN1P35523 988 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 NBPF4Q96M43 638 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 STK31Q9BXU1 1019 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 RTL1A6NKG5 1358 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 IGSF3O75054 1194 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 SDSP20132 328 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 AKAP12Q02952 1782 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 SBNO1A3KN83 1393 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-205ENST00000587860 USP31Q70CQ4 1352 aa18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms