RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SSH1Q8WYL5 1049 aa36.57■■■■□ 3.45
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCTN1Q14203 1278 aa36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 AAMPQ13685 434 aa36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRB1P82279 1406 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMC4Q9NTJ3 1288 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCA3Q99758 1704 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHL1O00533 1208 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 MS4A1P11836 297 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 VAMP4O75379 141 aa36.54■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAMTS2O95450 1211 aa36.53■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NBPF4Q96M43 638 aa36.52■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 PANK1Q8TE04 598 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCM10Q7L590 875 aa36.51■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC37A3O60309 1634 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF16BQ96L93 1317 aa36.49■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP6O75581 1613 aa36.49■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0232Q92628 1395 aa36.48■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 RLBP1P12271 317 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 COG6Q9Y2V7 657 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPDO75976 1380 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.45■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPYL6Q8N831 410 aa36.45■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K5Q99683 1374 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL18A1P39060 1754 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa36.43■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 C8orf58Q8NAV2 365 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-210ENST00000574322 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.42■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNA2Q15822 529 aa36.41■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX19BQ9UMR2 479 aa36.28■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHDP01880 384 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITPRIPQ8IWB1 547 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
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