RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572560.1

AKAP1-209, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP1, Length 442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-209ENST00000572560 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AKAP1-209ENST00000572560 USP47Q96K76 1375 aa22.33■■□□□ 1.17
AKAP1-209ENST00000572560 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.32■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.32■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 LTN1O94822 1766 aa22.3■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 SLC24A1O60721 1099 aa22.3■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.3■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.165e-7■■□□□ 12.5
AKAP1-209ENST00000572560 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.29■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.28■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 USP54Q70EL1 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.28■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 HOXC9P31274 260 aa22.27■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.27■■□□□ 1.16
AKAP1-209ENST00000572560 A0A1W2PP64 1363 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 MSL1Q68DK7 614 aa22.24■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 ATP10DQ9P241 1426 aa22.23■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.22■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 NSD2O96028 1365 aa22.21■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
AKAP1-209ENST00000572560 HSPA6P17066 643 aa22.2■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.2■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 AK7Q96M32 723 aa22.19■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.18■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.18■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 LY75O60449 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 RTL1A6NKG5 1358 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 NBPF4Q96M43 638 aa22.17■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 PALLDQ8WX93 1383 aa22.15■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.15■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 MEGF6O75095 1541 aa22.15■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
AKAP1-209ENST00000572560 FBLN1P23142 703 aa22.14■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 TONSLQ96HA7 1378 aa22.12■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.1■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.09■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 PHF14O94880 888 aa22.09■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 FYB1O15117 783 aa22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 SSFA2P28290 1259 aa22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.08■■□□□ 1.13
AKAP1-209ENST00000572560 ADCY9O60503 1353 aa22.08■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 INSRP06213 1382 aa22.07■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.06■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 TESK2Q96S53 571 aa22.06■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 SPG7Q9UQ90 795 aa22.06■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 CEP350Q5VT06 3117 aa22.06■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 APLP1P51693 650 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 TMF1P82094 1093 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 C5P01031 1676 aa22.04■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 FLT4P35916 1363 aa22.04■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 CYP27B1O15528 508 aa22.04■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 CDCA8Q53HL2 280 aa22.03■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 PIGBQ92521 554 aa22.03■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.02■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 SIK1P57059 783 aa22.02■■□□□ 1.12
AKAP1-209ENST00000572560 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.01■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.01■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 KIF3CO14782 793 aa22■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 GNPATO15228 680 aa22■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 TOMM70O94826 608 aa22■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 TGFB2P61812 414 aa22■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 ATP6V1AP38606 617 aa21.99■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 C4BP0C0L5 1744 aa21.98■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.98■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.117e-8■■□□□ 12.6
AKAP1-209ENST00000572560 MMP10P09238 476 aa21.97■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.96■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.96■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 BCS1LQ9Y276 419 aa21.96■■□□□ 1.11
AKAP1-209ENST00000572560 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.95■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 SMIM5Q71RC9 77 aa21.95■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.95■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.95■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.94■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.93■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.93■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 ADRA2BP18089 450 aa21.91■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.91■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 A0A0G2JLW4 131 aa21.9■■□□□ 1.1
AKAP1-209ENST00000572560 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms