RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.3■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 KDRP35968 1356 aa22.29■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.29■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 HMOX1P09601 288 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCC3-218ENST00000571855 NUDCQ9Y266 331 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 SBF2Q86WG5 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 SPG7Q9UQ90 795 aa22.25■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 BCL9O00512 1426 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 ANP32CO43423 234 aa22.23■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC125Q86Z20 511 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 CYP27B1O15528 508 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 TRIM37O94972 964 aa22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ABCC3-218ENST00000571855 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 FCHSD2O94868 740 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 PHKG2P15735 406 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 PRKAR2BP31323 418 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 KCNQ2O43526 872 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 NHSQ6T4R5 1651 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-218ENST00000571855 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 APBA3O96018 575 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC184Q52MB2 194 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 BAG6P46379 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 ITGB4P16144 1822 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 BTAF1O14981 1849 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 DCAF5Q96JK2 942 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCC3-218ENST00000571855 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.08■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.08■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.05■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.05■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 PLSCR1O15162 318 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 NEFMP07197 916 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 MRS2Q9HD23 443 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 PIGBQ92521 554 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 LGR6Q9HBX8 967 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 MAP3K5Q99683 1374 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCC3-218ENST00000571855 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 DLG5Q8TDM6 1919 aa22■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 CABP4P57796 275 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 PROM2Q8N271 834 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 IL17REQ8NFR9 667 aa21.98■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 NFE2L2Q16236 605 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 RUNDC1Q96C34 613 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 RREB1Q92766 1687 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 TXNRD1Q16881 649 aa21.96■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.95■■□□□ 1.11
ABCC3-218ENST00000571855 LY75O60449 1722 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCC3-218ENST00000571855 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ABCC3-218ENST00000571855 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ABCC3-218ENST00000571855 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCC3-218ENST00000571855 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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