RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 POM121CA8CG34 1229 aa10.02□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.02□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 USP4Q13107 963 aa10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.01□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 A6NJR5 290 aa10□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1W2PRU2 124 aa9.99□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 TRAK2O60296 914 aa9.99□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.99□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 NACADO15069 1562 aa9.99□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 MEN1O00255 615 aa9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 PIK3CDO00329 1044 aa9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.98□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 TREML4Q6UXN2 200 aa9.97□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.97□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 SIRT1Q96EB6 747 aa9.97□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.97□□□□□ -0.81
ATXN3-218ENST00000553309 SKIP12755 728 aa9.96□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 NLRP3Q96P20 1036 aa9.96□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 WFS1O76024 890 aa9.95□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 GNRH1P01148 92 aa9.95□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 VEGFBP49765 207 aa9.95□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 RNF217Q8TC41 542 aa9.94□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.94□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 CLN3Q13286 438 aa9.93□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.93□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.93□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.93□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.93□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 PTSQ03393 145 aa9.92□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.92□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.92□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 GPC1P35052 558 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 CNKSR1Q969H4 720 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 PPFIA3O75145 1194 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 EML3Q32P44 896 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 GLMNQ92990 594 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 XAGE2Q96GT9 111 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-218ENST00000553309 H3BM21 787 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 IL2RAP01589 272 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 CENPCQ03188 943 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 RHOQP17081 205 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 UCN2Q96RP3 112 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 NOD1Q9Y239 953 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 SLC35F4A4IF30 521 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L5A8MUK1 530 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 POU4F2Q12837 409 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 NCOA4Q13772 614 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 IRF7Q92985 503 aa9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ZMYND15Q9H091 742 aa9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.86□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ATP9BO43861 1147 aa9.85□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 LCE2CQ5TA81 110 aa9.85□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 INHAP05111 366 aa9.84□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 GDF10P55107 478 aa9.84□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ATXN3-218ENST00000553309 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L3A6NCW0 530 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L4A6NCW7 530 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 SCNN1DP51172 638 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 GTF2IP78347 998 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.83□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 ERBB4Q15303 1308 aa9.82□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
ATXN3-218ENST00000553309 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms