RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 USP26Q9BXU7 913 aa29.2■■■□□ 2.27
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NPAS3-211ENST00000551634 ITSN1Q15811 1721 aa29.2■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 PTPRCP08575 1304 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 CHL1O00533 1208 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 METP08581 1390 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 NUCB2P80303 420 aa29.18■■■□□ 2.26
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NPAS3-211ENST00000551634 ST18O60284 1047 aa29.08■■■□□ 2.25
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NPAS3-211ENST00000551634 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.08■■■□□ 2.25
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NPAS3-211ENST00000551634 MCM10Q7L590 875 aa29.04■■■□□ 2.24
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NPAS3-211ENST00000551634 TNRQ92752 1358 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 F6X3S4 739 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 GNAI3P08754 354 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 STK31Q9BXU1 1019 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
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