RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 NSD2O96028 1365 aa23.02■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.02■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 ATP10DQ9P241 1426 aa23.01■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.01■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.01■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 NLRP6P59044 892 aa23■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 AKT1S1Q96B36 256 aa23■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 CGNL1Q0VF96 1302 aa23■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 USP31Q70CQ4 1352 aa23■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 NFAT5O94916 1531 aa22.99■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.98■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 KLHL34Q8N239 644 aa22.97■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 EXOC5O00471 708 aa22.96■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 FYB1O15117 783 aa22.96■■□□□ 1.27
PACS1-208ENST00000529677 ADCY9O60503 1353 aa22.95■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 HSPA6P17066 643 aa22.94■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 NME9Q86XW9 330 aa22.94■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 LY75O60449 1722 aa22.89■■□□□ 1.26
PACS1-208ENST00000529677 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.89■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.88■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 POLD1P28340 1107 aa22.87■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 KCNQ4P56696 695 aa22.87■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 SOX12O15370 315 aa22.86■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 COG3Q96JB2 828 aa22.86■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 GRIN3BO60391 1043 aa22.84■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.83■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 RALBP1Q15311 655 aa22.83■■□□□ 1.25
PACS1-208ENST00000529677 ERBB3P21860 1342 aa22.82■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 LTN1O94822 1766 aa22.82■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 MORC1Q86VD1 984 aa22.82■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.82■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.81■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.8■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 KIF3CO14782 793 aa22.78■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 ANP32CO43423 234 aa22.78■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 IL2RBP14784 551 aa22.78■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.78■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACS1-208ENST00000529677 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.76■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.75■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.74■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 PPP2R1AP30153 589 aa22.73■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 MSL1Q68DK7 614 aa22.73■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 RTL1A6NKG5 1358 aa22.72■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 POLKQ9UBT6 870 aa22.71■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.71■■□□□ 1.23
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.7■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 INSRP06213 1382 aa22.7■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 C5P01031 1676 aa22.7■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 FBLN1P23142 703 aa22.68■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.68■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.68■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.67■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.67■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 WDR90Q96KV7 1748 aa22.67■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 FLT4P35916 1363 aa22.66■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.64■■□□□ 1.22
PACS1-208ENST00000529677 MTHFSP49914 203 aa22.64■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.64■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 APLP1P51693 650 aa22.63■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.63■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 MIER1Q8N108 512 aa22.63■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 CCER2I3L3R5 266 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 IP6K1Q92551 441 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 PCNTO95613 3336 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 MSH5O43196 834 aa22.61■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 HOXC9P31274 260 aa22.61■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.6■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 MEGF6O75095 1541 aa22.6■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 AMPHP49418 695 aa22.59■■□□□ 1.21
PACS1-208ENST00000529677 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.58■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 CFAP53Q96M91 514 aa22.57■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 C4BP0C0L5 1744 aa22.57■■□□□ 1.2
PACS1-208ENST00000529677 CAPN15O75808 1086 aa22.56■■□□□ 1.2
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