RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	KCNQ2	O43526	872 aa		29.22	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.2	■■■□□ 2.27
EML3-215	ENST00000526116	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	PROM2	Q8N271	834 aa		29.17	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.16	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.14	■■■□□ 2.26
EML3-215	ENST00000526116	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.12	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	EYA1	Q99502	592 aa		29.12	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.1	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.1	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	LY75	O60449	1722 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.05	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	CYP27B1	O15528	508 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	ITGB4	P16144	1822 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
EML3-215	ENST00000526116	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24	1e-8	■■■□□ 15.4
EML3-215	ENST00000526116	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.97	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.96	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.96	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.96	■■■□□ 2.23
EML3-215	ENST00000526116	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.94	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	KDR	P35968	1356 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	IL13	P35225	146 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	MTHFS	P49914	203 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	PHKG2	P15735	406 aa		28.9	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.9	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
EML3-215	ENST00000526116	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.88	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.88	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.88	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.88	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.87	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.87	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	C5	P01031	1676 aa		28.86	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.86	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	KCNQ4	P56696	695 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	PIGB	Q92521	554 aa		28.83	■■■□□ 2.21
EML3-215	ENST00000526116	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EML3-215	ENST00000526116	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	PTGER2	P43116	358 aa		28.75	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.74	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.74	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		28.73	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	HMOX1	P09601	288 aa		28.72	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.72	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.72	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.71	■■■□□ 2.19
EML3-215	ENST00000526116	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.7	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.69	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.69	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.69	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.68	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.68	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	SIK1	P57059	783 aa		28.68	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.67	■■■□□ 2.18
EML3-215	ENST00000526116	CABP4	P57796	275 aa		28.65	■■■□□ 2.18

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