RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		6.35	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	FSD2	A1L4K1	749 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	IRF6	O14896	467 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	COL9A1	P20849	921 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP2K5	Q13163	448 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	TNN	Q9UQP3	1299 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	ADGRB2	O60241	1585 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MORC1	Q86VD1	984 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	NSD2	O96028	1365 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS12	P56730	875 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNK17	Q96T54	332 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MROH2A	A6NES4	1674 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	NOS1	P29475	1434 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP33	O14559	1287 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF3B	O15066	747 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	DDIT3	P35638	169 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PSEN2	P49810	448 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	IL16	Q14005	1332 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEB3	A0JP26	581 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM66	O15016	1216 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MCM4	P33991	863 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MTHFS	P49914	203 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEB	Q6S5H4	581 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PADI6	Q6TGC4	694 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC102A	Q96A19	550 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	NPAT	Q14207	1427 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CD109	Q6YHK3	1445 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC5	Q8IY18	1101 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC13	Q8NBP0	860 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP53	Q96M91	514 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC11	Q96J66	1382 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	MED14	O60244	1454 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF1B	O60333	1816 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	OAT	P04181	439 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PBX2	P40425	430 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	TSKS	Q9UJT2	592 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	PPL	O60437	1756 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFYVE9	O95405	1425 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC3	O15438	1527 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM27	P14373	513 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE4D	Q08499	809 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	NEUROD2	Q15784	382 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PROX2	Q3B8N5	592 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PACS2	Q86VP3	889 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX21	Q969T3	373 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PIK3C2B	O00750	1634 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-212	ENST00000515746	PIK3R4	Q99570	1358 aa		6.27	□□□□□ -1.41

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