RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 HOXC9P31274 260 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1W2PP64 1363 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 USP47Q96K76 1375 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-215ENST00000510074 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 IFFO2Q5TF58 517 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 USP54Q70EL1 1684 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FBLN1P23142 703 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 MSL1Q68DK7 614 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 NSD2O96028 1365 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC24A1O60721 1099 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 NBPF4Q96M43 638 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 MEGF6O75095 1541 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 LY75O60449 1722 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP10DQ9P241 1426 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-215ENST00000510074 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP350Q5VT06 3117 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 AK7Q96M32 723 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 RTL1A6NKG5 1358 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 TONSLQ96HA7 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 FYB1O15117 783 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 TESK2Q96S53 571 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 PALLDQ8WX93 1383 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 PHF14O94880 888 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 HSPA6P17066 643 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-215ENST00000510074 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 CYP27B1O15528 508 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 INSRP06213 1382 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 TMF1P82094 1093 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 PIGBQ92521 554 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 SMIM5Q71RC9 77 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-215ENST00000510074 SPG7Q9UQ90 795 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 C5P01031 1676 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 FLT4P35916 1363 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SSFA2P28290 1259 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ADCY9O60503 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SIK1P57059 783 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CDCA8Q53HL2 280 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GNPATO15228 680 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP6V1AP38606 617 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-215ENST00000510074 C4BP0C0L5 1744 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF3CO14782 793 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 MMP10P09238 476 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 APLP1P51693 650 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ITPK1Q13572 414 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 BCS1LQ9Y276 419 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TGFB2P61812 414 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A0G2JLW4 131 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 TOMM70O94826 608 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-215ENST00000510074 EYA1Q99502 592 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 ATG3Q9NT62 314 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms