RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476472.5

ANKRD28-209, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-209ENST00000476472 DRC1Q96MC2 740 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-209ENST00000476472 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-209ENST00000476472 AGAP3Q96P47 875 aa4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-209ENST00000476472 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ANKRD28-209ENST00000476472 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 NAT1P18440 290 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SUFUQ9UMX1 484 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RGL2O15211 777 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 KIF5CO60282 957 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PPFIA2O75334 1257 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 BDNFP23560 247 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 MRE11P49959 708 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IFT88Q13099 833 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 ZSCAN26Q16670 478 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 ARSIQ5FYB1 569 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FEZ1Q99689 392 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SWAP70Q9UH65 585 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SMARCA2P51531 1590 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FSD2A1L4K1 749 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 GYS2P54840 703 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IRF5Q13568 498 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RASA3Q14644 834 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FILIP1LQ4L180 1135 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 NLRP13Q86W25 1043 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 DEF6Q9H4E7 631 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 WDR70Q9NW82 654 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 STK24Q9Y6E0 443 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 NCAPD3P42695 1498 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CFAP69A5D8W1 941 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 UQCRHP07919 91 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SKILP12757 684 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PBX2P40425 430 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TRPC1P48995 793 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 FOSBP53539 338 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PPP4CP60510 307 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TRAF1Q13077 416 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 MCM6Q14566 821 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 HS1BP3Q53T59 392 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RETREG2Q8NC44 543 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 C17orf50Q8WW18 174 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 PMM1Q92871 262 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 CCDC175P0C221 793 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TCF3P15923 654 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 KCNA2P16389 499 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 ATP6V1AP38606 617 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TMED1Q13445 227 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 MLECQ14165 292 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 MAP9Q49MG5 647 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-209ENST00000476472 C4orf46Q504U0 113 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms