RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM94Q12767 1356 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 SHPRHQ149N8 1683 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 NCOA2Q15596 1464 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-208ENST00000471759 MBD5Q9P267 1494 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-208ENST00000471759 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-208ENST00000471759 ABCC3O15438 1527 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF428Q96B54 188 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 STK26Q9P289 416 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 NWD1Q149M9 1564 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.134e-8■■■□□ 16.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 25.7
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RABGGTB-208ENST00000471759 PDE3BQ13370 1112 aa8□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 H0YHG0 523 aa7.99□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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RABGGTB-208ENST00000471759 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC189A1A4V9 331 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP2B1P20020 1258 aa7.97□□□□□ -1.13
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