RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.35■□□□□ 0.21
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PRAME-210ENST00000442481 COG3Q96JB2 828 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-210ENST00000442481 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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PRAME-210ENST00000442481 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.32■□□□□ 0.2
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PRAME-210ENST00000442481 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.28■□□□□ 0.2
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PRAME-210ENST00000442481 MSH5O43196 834 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-210ENST00000442481 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.27■□□□□ 0.2
PRAME-210ENST00000442481 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.27■□□□□ 0.2
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PRAME-210ENST00000442481 MEGF6O75095 1541 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 FBLN1P23142 703 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
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PRAME-210ENST00000442481 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 MSL1Q68DK7 614 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-210ENST00000442481 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.23■□□□□ 0.19
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PRAME-210ENST00000442481 TMF1P82094 1093 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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PRAME-210ENST00000442481 FLT4P35916 1363 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRAME-210ENST00000442481 INSRP06213 1382 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 PALLDQ8WX93 1383 aa16.18■□□□□ 0.18
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PRAME-210ENST00000442481 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-210ENST00000442481 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 C4BP0C0L5 1744 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 SMIM5Q71RC9 77 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 SPG7Q9UQ90 795 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 SSFA2P28290 1259 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 CYP27B1O15528 508 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 HSPA6P17066 643 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 PHF14O94880 888 aa16.09■□□□□ 0.17
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PRAME-210ENST00000442481 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 ITGB4P16144 1822 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-210ENST00000442481 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 SIK1P57059 783 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 NCAPD2Q15021 1401 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 PIGBQ92521 554 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 KIF3CO14782 793 aa16.05■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.05■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.05■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.04■□□□□ 0.16
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