RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 HS1BP3Q53T59 392 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TERF1P54274 439 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 MCTP1Q6DN14 999 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL6Q8N831 410 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 GNAI1P63096 354 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IFT57Q9NWB7 429 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FAM83GA6ND36 823 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 DCTN1Q14203 1278 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LTKP29376 864 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CPS1P31327 1500 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TTC22Q5TAA0 569 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 USP26Q9BXU7 913 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MBIPQ9NS73 344 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF853P0CG23 659 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 DCTPP1Q9H773 170 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 RBSNQ9H1K0 784 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ACEP12821 1306 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SIRT1Q96EB6 747 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.33■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.33■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PKP1Q13835 747 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ST18O60284 1047 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TECPR2O15040 1411 aa18.31■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CASC1Q6TDU7 716 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 GPT2Q8TD30 523 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EID1Q9Y6B2 187 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ATP10DQ9P241 1426 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 MAP7D2Q96T17 732 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SDSP20132 328 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 MCM5P33992 734 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KRT24Q2M2I5 525 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 REC8O95072 547 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MCM10Q7L590 875 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CEP85Q6P2H3 762 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3O95983 291 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRUQ92729 1446 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SYCE3A1L190 88 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRHP07919 91 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RGS12O14924 1447 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ERC2O15083 957 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms