RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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PTPRM-202ENST00000400053 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-202ENST00000400053 CD109Q6YHK3 1445 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-202ENST00000400053 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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PTPRM-202ENST00000400053 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 PANK2Q9BZ23 570 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 IQCEQ6IPM2 695 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-202ENST00000400053 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.43□□□□□ -0.74
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