RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 HOMER1Q86YM7 354 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 NCOA1Q15788 1441 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 IFT57Q9NWB7 429 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRCP08575 1304 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRD-201ENST00000355233 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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