RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 RAD21O60216 631 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 TXNRD1Q16881 649 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 SIRT1Q96EB6 747 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 IP6K1Q92551 441 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WZG4 1122 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 H0YIN7 160 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 SLIT1O75093 1534 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 APAF1O14727 1248 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN15O75808 1086 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 DCTN1Q14203 1278 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 MCM10Q7L590 875 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 KCNQ2O43526 872 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRUQ92729 1446 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP3Q96P20 1036 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R1AP30153 589 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 CNBD1Q8NA66 436 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-201ENST00000348564 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 EYA1Q99502 592 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PP64 1363 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 AIDAQ96BJ3 306 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.59□□□□□ -1.52
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