RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 GCP02774 474 aa21.69■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 IGHDP01880 384 aa21.68■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 CHL1O00533 1208 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 BRINP3Q76B58 766 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 TSPYL6Q8N831 410 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 PDE4AP27815 886 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 MCM10Q7L590 875 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 CRB1P82279 1406 aa21.64■■□□□ 1.06
SSR4-201ENST00000320857 KIAA0232Q92628 1395 aa21.64■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 BACH2Q9BYV9 841 aa21.64■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.64■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.63■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 SKAP1Q86WV1 359 aa21.63■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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SSR4-201ENST00000320857 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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SSR4-201ENST00000320857 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.6■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.59■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 FBXO41Q8TF61 875 aa21.59■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SSR4-201ENST00000320857 MAP3K5Q99683 1374 aa21.58■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 RGS3P49796 1198 aa21.57■■□□□ 1.04
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SSR4-201ENST00000320857 NBPF4Q96M43 638 aa21.57■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.57■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.56■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.56■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 ABCC4O15439 1325 aa21.55■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 NCAPD2Q15021 1401 aa21.55■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHG5O94827 1062 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 FAM161AQ3B820 660 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.54■■□□□ 1.04
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SSR4-201ENST00000320857 LRRC37A3O60309 1634 aa21.54■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.53■■□□□ 1.04
SSR4-201ENST00000320857 HSPA1LP34931 641 aa21.53■■□□□ 1.04
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SSR4-201ENST00000320857 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.52■■□□□ 1.04
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SSR4-201ENST00000320857 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-201ENST00000320857 RGPD5Q99666 1765 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-201ENST00000320857 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SSR4-201ENST00000320857 IL17REQ8NFR9 667 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-201ENST00000320857 COL18A1P39060 1754 aa21.49■■□□□ 1.03
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SSR4-201ENST00000320857 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SSR4-201ENST00000320857 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.48■■□□□ 1.03
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SSR4-201ENST00000320857 C8orf34Q49A92 452 aa21.47■■□□□ 1.03
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SSR4-201ENST00000320857 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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SSR4-201ENST00000320857 STK31Q9BXU1 1019 aa21.43■■□□□ 1.02
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SSR4-201ENST00000320857 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.42■■□□□ 1.02
SSR4-201ENST00000320857 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SSR4-201ENST00000320857 RGS12O14924 1447 aa21.41■■□□□ 1.02
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SSR4-201ENST00000320857 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.39■■□□□ 1.02
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