RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293748.9

SYNGAP1-201, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 4,556 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-201ENST00000293748 RTL1A6NKG5 1358 aa14.68□□□□□ -0.06
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SYNGAP1-201ENST00000293748 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.64□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-201ENST00000293748 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.62□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-201ENST00000293748 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.55□□□□□ -0.08
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SYNGAP1-201ENST00000293748 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 AKAP12Q02952 1782 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 CCDC125Q86Z20 511 aa14.53□□□□□ -0.08
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SYNGAP1-201ENST00000293748 ATRNO75882 1429 aa14.52□□□□□ -0.08
SYNGAP1-201ENST00000293748 HMOX1P09601 288 aa14.52□□□□□ -0.08
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