RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 IL17REQ8NFR9 667 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 ARHGEF10O15013 1369 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 MYT1Q01538 1121 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 LTN1O94822 1766 aa7.21□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 NWD1Q149M9 1564 aa7.21□□□□□ -1.25
USP15-201ENST00000280377 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 LGR6Q9HBX8 967 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 CRB1P82279 1406 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 KIF16BQ96L93 1317 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 NFAT5O94916 1531 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 CHRNA2Q15822 529 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 G2E3Q7L622 706 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MST1RQ04912 1400 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MS4A1P11836 297 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SLC4A2P04920 1241 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 C8orf34Q49A92 452 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MSH6P52701 1360 aa7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 F6X3S4 739 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 KCNQ3O43525 872 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 RGPD5Q99666 1765 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SEC24BO95487 1268 aa7.18□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 BRINP3Q76B58 766 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 USP19O94966 1318 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 STRCQ7RTU9 1775 aa7.17□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ABCC4O15439 1325 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 RTL1A6NKG5 1358 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MAP3K5Q99683 1374 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 FAM161AQ3B820 660 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ERBB3P21860 1342 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 USP54Q70EL1 1684 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 ANXA1P04083 346 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 LNPKQ9C0E8 428 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SLAIN2Q9P270 581 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.16□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 KIAA0232Q92628 1395 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 AAMPQ13685 434 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 MEIS3Q99687 375 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 PXDNQ92626 1479 aa7.15□□□□□ -1.26
USP15-201ENST00000280377 RGS12O14924 1447 aa7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 SMC5Q8IY18 1101 aa7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 SLIT3O75094 1523 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 USP35Q9P2H5 1018 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.14□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 TEFQ10587 303 aa7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 ALS2Q96Q42 1657 aa7.13□□□□□ -1.27
USP15-201ENST00000280377 BTBD11A6QL63 1104 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms