RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234347.9

PRTN3-201, Transcript of proteinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRTN3, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3-201ENST00000234347 KDRP35968 1356 aa27.34■■□□□ 1.97
PRTN3-201ENST00000234347 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.33■■□□□ 1.97
PRTN3-201ENST00000234347 SOCS7O14512 581 aa27.31■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 HMOX1P09601 288 aa27.3■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PRTN3-201ENST00000234347 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.26■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 BCL9O00512 1426 aa27.24■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.23■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 SBF2Q86WG5 1849 aa27.23■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 ANP32CO43423 234 aa27.23■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.22■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.22■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 CYP27B1O15528 508 aa27.22■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 NUDCQ9Y266 331 aa27.22■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
PRTN3-201ENST00000234347 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.2■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 SPG7Q9UQ90 795 aa27.2■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 TRIM37O94972 964 aa27.19■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.19■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 NHSQ6T4R5 1651 aa27.18■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.18■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.18■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC184Q52MB2 194 aa27.17■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.17■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 PHKG2P15735 406 aa27.15■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 PRKAR2BP31323 418 aa27.15■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 KCNQ2O43526 872 aa27.14■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.14■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PRTN3-201ENST00000234347 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.12■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.11■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 FCHSD2O94868 740 aa27.1■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.1■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC125Q86Z20 511 aa27.1■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 BTAF1O14981 1849 aa27.08■■□□□ 1.93
PRTN3-201ENST00000234347 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.06■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 ITGB4P16144 1822 aa27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 APBA3O96018 575 aa27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.05■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.04■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 MRS2Q9HD23 443 aa27.04■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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PRTN3-201ENST00000234347 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.03■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.02■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 BAG6P46379 1132 aa27.02■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.02■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.02■■□□□ 1.92
PRTN3-201ENST00000234347 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 DCAF5Q96JK2 942 aa27.01■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 MAP3K5Q99683 1374 aa27■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.99■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 LGR6Q9HBX8 967 aa26.98■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.97■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 RREB1Q92766 1687 aa26.97■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.96■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 MRC1P22897 1456 aa26.96■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 PIGBQ92521 554 aa26.96■■□□□ 1.91
PRTN3-201ENST00000234347 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.95■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.95■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.94■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.94■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 PLSCR1O15162 318 aa26.93■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.93■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 NEFMP07197 916 aa26.92■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 NFE2L2Q16236 605 aa26.92■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 IL17REQ8NFR9 667 aa26.92■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 LY75O60449 1722 aa26.91■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 CABP4P57796 275 aa26.91■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 PROM2Q8N271 834 aa26.91■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 RUNDC1Q96C34 613 aa26.91■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.89■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.89■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.89■■□□□ 1.9
PRTN3-201ENST00000234347 PALLDQ8WX93 1383 aa26.88■■□□□ 1.89
PRTN3-201ENST00000234347 DCTN1Q14203 1278 aa26.88■■□□□ 1.89
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