RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.34■■□□□ 1.17
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CGRRF1-201ENST00000216420 ERC2O15083 957 aa22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 IL17RAQ96F46 866 aa22.33■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 ASXL2Q76L83 1435 aa22.33■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM4AO75164 1064 aa22.32■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.162e-6■□□□□ 10.1
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CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.31■■□□□ 1.16
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CGRRF1-201ENST00000216420 ATP10DQ9P241 1426 aa22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM177BA6PVY3 158 aa22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.3■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 FCHSD2O94868 740 aa22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 MX1P20591 662 aa22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.29■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.28■■□□□ 1.16
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CGRRF1-201ENST00000216420 FBLN2P98095 1184 aa22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 NEK4P51957 841 aa22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CGRRF1-201ENST00000216420 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.27■■□□□ 1.16
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CGRRF1-201ENST00000216420 GLI2P10070 1586 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT57Q9NWB7 429 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 RGS12O14924 1447 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ZFYVE9O95405 1425 aa22.26■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF853P0CG23 659 aa22.25■■□□□ 1.15
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CGRRF1-201ENST00000216420 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 TCHHQ07283 1943 aa22.25■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 SLFN14P0C7P3 912 aa22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 GNAI1P63096 354 aa22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1W2PP64 1363 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM193AP78312 1265 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC20A2Q08357 652 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 MPNDQ8N594 471 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 SSH2Q76I76 1423 aa22.23■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.22■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 SMTNL1A8MU46 457 aa22.21■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 UBE2HP62256 183 aa22.21■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPYL6Q8N831 410 aa22.21■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.2■■□□□ 1.15
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC66A2RUB6 948 aa22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 MCCP23508 829 aa22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 NFE2L2Q16236 605 aa22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP85Q6P2H3 762 aa22.19■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.18■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 AP5Z1O43299 807 aa22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.17■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 IGSF3O75054 1194 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 TERF2Q15554 542 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 MBIPQ9NS73 344 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 FYB1O15117 783 aa22.15■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.15■■□□□ 1.14
CGRRF1-201ENST00000216420 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.15■■□□□ 1.14
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