RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000159111.8

KDM4B-201, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4B, Length 5,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-201ENST00000159111 AK7Q96M32 723 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.24■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 STK3Q13188 491 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 MCM10Q7L590 875 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 RUFY1Q96T51 708 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 TNMDQ9H2S6 317 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 KDM4AO75164 1064 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 CDR1P51861 262 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 NME9Q86XW9 330 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 MX1P20591 662 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 MTMR7Q9Y216 660 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 NUP160Q12769 1436 aa20.22■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 PTPRCP08575 1304 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 CFAP45Q9UL16 551 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 MAP7D2Q96T17 732 aa20.21■□□□□ 0.83
KDM4B-201ENST00000159111 OFD1O75665 1012 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 STARD3NLO95772 234 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 IL16Q14005 1332 aa20.2■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 ATP2B1P20020 1258 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 ME1P48163 572 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 MCM4P33991 863 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.19■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 IDI1Q13907 227 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 WASF1Q92558 559 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 SPATA32Q96LK8 384 aa20.18■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CAGE1Q8TC20 777 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 PLCH2O75038 1416 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CBFA2T2O43439 604 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.16■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 STIM1Q13586 685 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 MAPKBP1O60336 1514 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 DCTN1Q14203 1278 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.15■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 TDO2P48775 406 aa20.14■□□□□ 0.82
KDM4B-201ENST00000159111 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 SERPINC1P01008 464 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 HYPKQ9NX55 129 aa20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 SOGA3Q5TF21 947 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 MYO6Q9UM54 1294 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 ODF2Q5BJF6 829 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms