RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm7361D3Z6R1 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm1979E9QAN3 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm5862K7N5V5 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm10220K7N660 267 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Jdp2P97875 163 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Chrna2Q91X60 512 aa22.94■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa22.93■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Bicdl1A0JNT9 577 aa22.93■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zfp777B9EKF4 885 aa22.93■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Igsf1Q7TQA1 1317 aa22.92■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MeiocA2AG06 965 aa22.92■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppm1fQ8CGA0 452 aa22.92■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zcwpw1Q6IR42 630 aa22.91■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc5a1Q8C3K6 665 aa22.91■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppp1r15aP17564 657 aa22.9■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NppbP40753 121 aa22.9■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MpripP97434 1024 aa22.9■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hirip3Q8BLH7 601 aa22.9■■□□□ 1.26
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa22.89■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Emilin1Q99K41 1017 aa22.89■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Trim28Q62318 834 aa22.88■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ErfeQ6PGN1 340 aa22.86■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rsph6aQ8CDR2 708 aa22.86■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa22.86■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abca3Q8R420 1704 aa22.85■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppef1O35655 650 aa22.85■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plin1Q8CGN5 517 aa22.84■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa22.84■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.83■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Chmp7Q8R1T1 451 aa22.83■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Phkg2Q9DB30 406 aa22.83■■□□□ 1.25
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Msl1Q6PDM1 616 aa22.82■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rad23bP54728 416 aa22.81■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Asic4Q7TNS7 539 aa22.81■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 HypkQ9CR41 129 aa22.81■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rnf180Q3U827 592 aa22.8■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Jmjd4Q8BFT6 427 aa22.8■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Shank3Q4ACU6 1730 aa22.79■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Magea6O89010 325 aa22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Magea3Q6T340 320 aa22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Crb1Q8VHS2 1405 aa22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pdzd9Q9D9M4 266 aa22.78■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tns2Q8CGB6 1400 aa22.77■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Smarcc1P97496 1104 aa22.77■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ssfa2Q922B9 1252 aa22.76■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col23a1Q8K4G2 532 aa22.75■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Amotl1Q9D4H4 968 aa22.75■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc34a2Q9DBP0 697 aa22.75■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kcnn1Q9EQR3 537 aa22.75■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PappaQ8R4K8 1624 aa22.75■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ints5Q8CHT3 1018 aa22.74■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp21Q9QZL6 566 aa22.74■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm13023A2A8N2 498 aa22.73■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atg3Q9CPX6 314 aa22.73■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22.72■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa22.72■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sumf1Q8R0F3 372 aa22.72■■□□□ 1.23
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dcaf5Q80T85 946 aa22.7■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sgip1Q8VD37 806 aa22.7■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Yy1Q00899 414 aa22.68■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prom2Q3UUY6 835 aa22.68■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Miga2Q8BK03 593 aa22.68■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 TnikP83510 1323 aa22.67■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gpr162Q3UN16 588 aa22.66■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cap2Q9CYT6 476 aa22.66■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PalmQ9Z0P4 383 aa22.66■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mcm10Q0VBD2 885 aa22.65■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.65■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Spata31d1bE9QA57 1361 aa22.64■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Aox2Q5SGK3 1345 aa22.63■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stk31Q99MW1 1018 aa22.62■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrp5Q91VN0 1614 aa22.61■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccdc155Q80VJ8 648 aa22.61■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sned1Q70E20 1403 aa22.6■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa22.6■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sos1Q62245 1319 aa22.58■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tsen2Q6P7W5 460 aa22.58■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 P2rx7Q9Z1M0 595 aa22.58■■□□□ 1.21
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pde4dQ01063 747 aa22.57■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrrc43Q3V0L5 667 aa22.57■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa22.57■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Iqcf3Q9D498 203 aa22.56■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa22.55■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tgfb2P27090 414 aa22.54■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CpzQ8R4V4 654 aa22.54■■□□□ 1.2
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 SnrkQ8VDU5 748 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms