RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	SMOX	Q9NWM0	555 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT9A	O14904	365 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	HAUS5	O94927	633 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MT-ND3	P03897	115 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	GM2A	P17900	193 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT15	P19012	456 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	WAS	P42768	502 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC1A2	P43004	574 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCN5	P51795	746 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	METAP1	P53582	386 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	POU4F1	Q01851	419 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	NFATC2	Q13469	925 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA9	Q13797	1035 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	LCA5	Q86VQ0	697 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS39	Q96JC1	886 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CABS1	Q96KC9	395 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	IER2	Q9BTL4	223 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPH	Q9H3R5	247 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MKS1	Q9NXB0	559 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TBK1	Q9UHD2	729 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIO	O75962	3097 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM23	A6NLE4	172 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529		A6NNZ2	444 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MID1	O15344	667 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TYROBP	O43914	113 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	DNTT	P04053	509 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PYGL	P06737	847 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	COL6A2	P12110	1019 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGAL	P20701	1170 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CD72	P21854	359 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TEAD1	P28347	426 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC26A3	P40879	764 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNF	P41002	786 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMD8	P48556	350 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	LIG3	P49916	1009 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R38	P59533	333 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ITIH4	Q14624	930 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TMED2	Q15363	201 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNA6	Q15825	494 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	INSC	Q1MX18	579 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZVL8	140 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	DTD2	Q96FN9	168 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRD	Q9H2X0	955 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB8	Q9H765	288 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	VWA7	Q9Y334	891 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PPM1	405 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51F1	A6NGY5	319 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM170B	A6NMN3	283 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL22	O00626	93 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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