RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P SUE1Q06524 206 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P TAH18Q12181 623 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P KTR1P27810 393 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PRO3P32263 286 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P BCS1P32839 456 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL050CP38721 697 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P STM1P39015 273 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P GPB2P39717 880 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MXR1P40029 184 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SKP2P42843 763 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PRY3P47033 881 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SOL4P53315 255 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P YAF9P53930 226 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ICL2Q12031 575 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD61Q99359 647 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P DIT2P21595 489 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P RIT1P23796 513 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P DLD1P32891 587 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P NDT80P38830 627 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P NOC2P39744 710 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P BBC1P47068 1157 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P FOL1P53848 824 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P HDA1P53973 706 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UFD2P54860 961 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS30Q02948 557 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P SKG3Q06315 1026 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P BRE1Q07457 700 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P AHC1Q12433 566 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P LAM4P38800 1345 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)PtW(CCA)P FLO1P32768 1537 aa3.09□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P GSC2P40989 1895 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P PDC1P06169 563 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YUR1P26725 428 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P IMP2'P32351 346 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P ANP1P32629 500 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RGT1P32862 1170 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P NPL4P33755 580 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P TGL1P34163 548 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YKR018CP36114 725 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P MET1P36150 593 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P GEF1P37020 779 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P REG2P38232 338 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS45P38932 577 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM21P40563 679 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P CTR1P49573 406 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR125WP53273 1036 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P NKP2Q06162 153 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P CSC1Q06538 782 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P ERP3Q12403 225 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P NUC1P08466 329 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P OPI1P21957 404 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P IRE1P32361 1115 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS29P38759 282 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P INP51P40559 946 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YFL040WP43562 540 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS53P47061 822 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P FMS1P50264 508 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL115CP53925 644 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P EAR1Q03212 550 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS72Q03388 795 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM30Q06673 1274 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P OXR1Q08952 273 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM20Q12033 661 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM11Q12463 433 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RTP1Q12751 981 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR084WA2P2R3 262 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P MAS2P11914 482 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P POX1P13711 748 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P TFC4P33339 1025 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P RER2P35196 286 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P MYO3P36006 1272 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P FLR1P38124 548 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)PtW(CCA)P LSB1P53281 241 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms