RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J SUE1Q06524 206 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J TAH18Q12181 623 aa3.11□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J KTR1P27810 393 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PRO3P32263 286 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J BCS1P32839 456 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL050CP38721 697 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J STM1P39015 273 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J GPB2P39717 880 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MXR1P40029 184 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SKP2P42843 763 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PRY3P47033 881 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SOL4P53315 255 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J YAF9P53930 226 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ICL2Q12031 575 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD61Q99359 647 aa3.1□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J DIT2P21595 489 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J RIT1P23796 513 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J DLD1P32891 587 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J NDT80P38830 627 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J NOC2P39744 710 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J BBC1P47068 1157 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J FOL1P53848 824 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J HDA1P53973 706 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UFD2P54860 961 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS30Q02948 557 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J SKG3Q06315 1026 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J BRE1Q07457 700 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J AHC1Q12433 566 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J LAM4P38800 1345 aa3.09□□□□□ -1.91
tW(CCA)JtW(CCA)J FLO1P32768 1537 aa3.09□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J GSC2P40989 1895 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J PDC1P06169 563 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YUR1P26725 428 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J IMP2'P32351 346 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ANP1P32629 500 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RGT1P32862 1170 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J NPL4P33755 580 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TGL1P34163 548 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR018CP36114 725 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MET1P36150 593 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J GEF1P37020 779 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J REG2P38232 338 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS45P38932 577 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM21P40563 679 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CTR1P49573 406 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR125WP53273 1036 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J NKP2Q06162 153 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CSC1Q06538 782 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ERP3Q12403 225 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.08□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J NUC1P08466 329 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J OPI1P21957 404 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J IRE1P32361 1115 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS29P38759 282 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J INP51P40559 946 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL040WP43562 540 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS53P47061 822 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J FMS1P50264 508 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL115CP53925 644 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J EAR1Q03212 550 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS72Q03388 795 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM30Q06673 1274 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J OXR1Q08952 273 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM20Q12033 661 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM11Q12463 433 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RTP1Q12751 981 aa3.07□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR084WA2P2R3 262 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MAS2P11914 482 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J POX1P13711 748 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC4P33339 1025 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J RER2P35196 286 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J MYO3P36006 1272 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J FLR1P38124 548 aa3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
tW(CCA)JtW(CCA)J LSB1P53281 241 aa3.06□□□□□ -1.92
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