RNA–Protein interactions for RNA: YNR001C

CIT1, Transcript of Citrate synthase, yeast

Gene CIT1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIT1	YNR001C	PAN5	P38787	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	MDJ2	P42834	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	SOG2	Q08817	791 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	FUS1	P11710	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	FIR1	P40020	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CIT1	YNR001C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	RAD55	P38953	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ATG1	P53104	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	WHI5	Q12416	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	PSY2	P40164	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	MAD1	P40957	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	VPS72	Q03388	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	TRP3	P00937	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	TOM20	P35180	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YKR073C	P36153	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	GUP1	P53154	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	CTR9	P89105	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	REC8	Q12188	680 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	COB	P00163	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	TSR4	P25040	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	RSC6	P25632	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	VAC8	P39968	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	AVT1	P47082	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YJR107W	P47145	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	DSE4	P53753	1117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	GLO4	Q12320	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	SMC1	P32908	1225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	QDR1	P40475	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ACF4	P47129	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YJR124C	P47159	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	MED7	Q08278	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ATG36	P46983	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	NUT2	Q06213	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	AOS1	Q06624	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ATG2	P53855	1592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ERS1	P17261	260 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	CLN2	P20438	545 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	COQ2	P32378	372 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	DUR3	P33413	735 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	SAF1	P38352	637 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YBR287W	P38355	427 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	AKR1	P39010	764 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	NCE103	P53615	221 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
CIT1	YNR001C	MNL2	Q12205	849 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIT1	YNR001C	SSN2	P38931	1420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	KAE1	P36132	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	LEM3	P42838	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	YJL049W	P47048	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	UBX5	Q06682	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	PEP7	P32609	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	ELM1	P32801	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	NEO1	P40527	1151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	CTH1	P47976	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	ELG1	Q12050	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	MET4	P32389	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	ALG12	P53730	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	FRT1	Q99332	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	YGR130C	P53278	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CIT1	YNR001C	RSC4	Q02206	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	CIT2	P08679	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CIT1	YNR001C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CIT1	YNR001C	SEA4	P38164	1038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	TOS1	P38288	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	RIM11	P38615	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	CWC24	P53769	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	RMD1	Q03441	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	PIN2	Q12057	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	DRS2	P39524	1355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	LIP5	P32875	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	SWE1	P32944	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIT1	YNR001C	FET4	P40988	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms