RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCZ1B-215	ENST00000626257	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	GNAI1	P63096	354 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	VAMP4	O75379	141 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	NFKBIB	Q15653	356 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF853	P0CG23	659 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CCZ1B-215	ENST00000626257	LTK	P29376	864 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMC5	Q8IY18	1101 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	ACE	P12821	1306 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	BECN1	Q14457	450 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	USP6	P35125	1406 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CCZ1B-215	ENST00000626257	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	NUCB1	Q02818	461 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCC4	O15439	1325 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CCZ1B-215	ENST00000626257	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	LNPK	Q9C0E8	428 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLIT1	O75093	1534 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CCZ1B-215	ENST00000626257	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	GCC1	Q96CN9	775 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	SOX12	O15370	315 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	GSE1	Q14687	1217 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHL1	O00533	1208 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	MCM10	Q7L590	875 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CCZ1B-215	ENST00000626257	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CCZ1B-215	ENST00000626257	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	FLT4	P35916	1363 aa		33	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	CRB1	P82279	1406 aa		33	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	RGS12	O14924	1447 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CCZ1B-215	ENST00000626257	FOXO3	O43524	673 aa		32.96	■■■□□ 2.87

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