RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 NFAT5O94916 1531 aa26.09■■□□□ 1.77
AP2S1-208ENST00000600964 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
AP2S1-208ENST00000600964 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.07■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.07■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.07■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.05■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.05■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.03■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 USP31Q70CQ4 1352 aa26.03■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.02■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.02■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.02■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.02■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 ABCC6O95255 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
AP2S1-208ENST00000600964 LTN1O94822 1766 aa26■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 DDB1Q16531 1140 aa26■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 CARD10Q9BWT7 1032 aa26■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 BCL9O00512 1426 aa25.99■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.97■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 PLSCR1O15162 318 aa25.96■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.96■■□□□ 1.75
AP2S1-208ENST00000600964 SOX12O15370 315 aa25.95■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 NME9Q86XW9 330 aa25.94■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 TONSLQ96HA7 1378 aa25.94■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 TESK2Q96S53 571 aa25.92■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 NBPF14Q5TI25 921 aa25.91■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC7Q96M83 1385 aa25.91■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 PROM2Q8N271 834 aa25.9■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 TMC1Q8TDI8 760 aa25.89■■□□□ 1.74
AP2S1-208ENST00000600964 A0A1W2PP64 1363 aa25.88■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.88■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 ERBB3P21860 1342 aa25.88■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 EXOC5O00471 708 aa25.87■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.86■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 CASZ1Q86V15 1759 aa25.86■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.85■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.84■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 TNS2Q63HR2 1409 aa25.84■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 NHSQ6T4R5 1651 aa25.83■■□□□ 1.73
AP2S1-208ENST00000600964 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.81■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.79■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.79■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.78■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 KCNQ2O43526 872 aa25.78■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 BTAF1O14981 1849 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 SLC24A1O60721 1099 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 IL2RBP14784 551 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 IP6K1Q92551 441 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 SPON1Q9HCB6 807 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2S1-208ENST00000600964 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
AP2S1-208ENST00000600964 TXNRD1Q16881 649 aa25.75■■□□□ 1.71
AP2S1-208ENST00000600964 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
AP2S1-208ENST00000600964 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.71■■□□□ 1.71
AP2S1-208ENST00000600964 FBLN1P23142 703 aa25.7■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.7■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 PAPPAQ13219 1627 aa25.7■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.69■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.69■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 SLC15A2Q16348 729 aa25.68■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 COG3Q96JB2 828 aa25.68■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 HOXC9P31274 260 aa25.67■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 FYB1O15117 783 aa25.66■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 USP47Q96K76 1375 aa25.66■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 PTGER2P43116 358 aa25.65■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.64■■□□□ 1.7
AP2S1-208ENST00000600964 TMF1P82094 1093 aa25.63■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 STK32BQ9NY57 414 aa25.63■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 MYOM1P52179 1685 aa25.63■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.61■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 ZBTB7AO95365 584 aa25.61■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.61■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 AMPHP49418 695 aa25.6■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.6■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 LY75O60449 1722 aa25.6■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 RTL1A6NKG5 1358 aa25.59■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.59■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.58■■□□□ 1.69
AP2S1-208ENST00000600964 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 MEGF6O75095 1541 aa25.57■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.57■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.56■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.56■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 NBPF4Q96M43 638 aa25.56■■□□□ 1.68
AP2S1-208ENST00000600964 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms