RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591545.5

SMARCA4-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCA4, Length 5,193 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4-216ENST00000591545 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 NFKBIBQ15653 356 aa15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 HOMER1Q86YM7 354 aa15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 FSD1Q9BTV5 496 aa15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 ABCC5O15440 1437 aa15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 MYL6BP14649 208 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 FCHSD2O94868 740 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 CNTROBQ8N137 903 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 GNAI2P04899 355 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 LNPKQ9C0E8 428 aa15.97■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 MSH6P52701 1360 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 ASXL2Q76L83 1435 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 MBD3O95983 291 aa15.96■□□□□ 0.15
SMARCA4-216ENST00000591545 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.96■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PTPRKQ15262 1439 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 CDR1P51861 262 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 EXOC5O00471 708 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 MCM2P49736 904 aa15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 ZPR1O75312 459 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PANK1Q8TE04 598 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 HIP1O00291 1037 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.141e-8■■□□□ 12.2
SMARCA4-216ENST00000591545 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 XBP1P17861 261 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 MNS1Q8NEH6 495 aa15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PSMA5P28066 241 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 WDR63Q8IWG1 891 aa15.92■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PDE4CQ08493 712 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 AK7Q96M32 723 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 IFT57Q9NWB7 429 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 MTMR7Q9Y216 660 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 NFE2L2Q16236 605 aa15.9■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SMARCA4-216ENST00000591545 PDE3AQ14432 1141 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC184Q52MB2 194 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 RUFY1Q96T51 708 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 RABEP1Q15276 862 aa15.89■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 PLCH2O75038 1416 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 TRAK2O60296 914 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 PDCP20941 246 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 OLFM4Q6UX06 510 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NME9Q86XW9 330 aa15.88■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 CCP110O43303 1012 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NCOA1Q15788 1441 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF428Q96B54 188 aa15.87■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 GCC1Q96CN9 775 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.85■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.85■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 SIL1Q9H173 461 aa15.85■□□□□ 0.13
SMARCA4-216ENST00000591545 NOS1P29475 1434 aa15.85■□□□□ 0.13
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