RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 SLIT3O75094 1523 aa22.2■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 PIK3C2AO00443 1686 aa22.19■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 USP6P35125 1406 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 CABP1Q9NZU7 370 aa22.18■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 MYOM1P52179 1685 aa22.17■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 PROM2Q8N271 834 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT20-216ENST00000588477 CHD4Q14839 1912 aa22.14■■□□□ 1.14
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IFT20-216ENST00000588477 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.13■■□□□ 1.13
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IFT20-216ENST00000588477 TNS2Q63HR2 1409 aa21.98■■□□□ 1.11
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IFT20-216ENST00000588477 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.76■■□□□ 1.07
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IFT20-216ENST00000588477 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.73■■□□□ 1.07
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