RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 USP54Q70EL1 1684 aa26.99■■□□□ 1.91
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SPHK1-204ENST00000587167 DISP2A7MBM2 1401 aa26.98■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 SLIT3O75094 1523 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 EVA1CP58658 441 aa26.97■■□□□ 1.91
SPHK1-204ENST00000587167 PANK3Q9H999 370 aa26.97■■□□□ 1.91
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SPHK1-204ENST00000587167 COL18A1P39060 1754 aa26.92■■□□□ 1.9
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SPHK1-204ENST00000587167 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.86■■□□□ 1.89
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SPHK1-204ENST00000587167 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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SPHK1-204ENST00000587167 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.61■■□□□ 1.85
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SPHK1-204ENST00000587167 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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SPHK1-204ENST00000587167 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 TNS2Q63HR2 1409 aa26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 FLT4P35916 1363 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 PROM2Q8N271 834 aa26.52■■□□□ 1.84
SPHK1-204ENST00000587167 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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