RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	30.62	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM182B	Q5T319	152 aa		30.61	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	RGPD5	Q99666	1765 aa		30.61	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX12	O15370	315 aa		30.6	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC6	O95255	1503 aa		30.58	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TMF1	P82094	1093 aa		30.57	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		30.57	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	30.56	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		30.56	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		30.56	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		30.56	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	30.56	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		30.54	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	30.54	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		30.53	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	LTN1	O94822	1766 aa		30.52	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		30.52	■■■□□ 2.48
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		30.5	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	30.5	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		30.5	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE3B	Q13370	1112 aa		30.49	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA8	Q53HL2	280 aa		30.47	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	DISP2	A7MBM2	1401 aa		30.47	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC37A3	O60309	1634 aa		30.47	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		30.47	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	BAG6	P46379	1132 aa		30.46	■■■□□ 2.47
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOM1	P52179	1685 aa		30.44	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM37	O94972	964 aa		30.42	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		30.42	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PEAK1	Q9H792	1746 aa		30.42	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ERBB3	P21860	1342 aa		30.42	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	COG3	Q96JB2	828 aa		30.4	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	30.4	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	30.39	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC7	Q96M83	1385 aa		30.39	■■■□□ 2.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DDB1	Q16531	1140 aa		30.39	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FYB1	O15117	783 aa		30.38	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	IP6K1	Q92551	441 aa		30.35	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		30.35	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		30.34	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		30.34	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SBF2	Q86WG5	1849 aa		30.34	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FBLN1	P23142	703 aa		30.33	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		30.33	■■■□□ 2.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	30.31	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		30.31	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL9	O00512	1426 aa		30.31	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	APBA3	O96018	575 aa		30.3	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	30.3	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	30.3	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	30.29	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		30.28	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	30.28	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TNS2	Q63HR2	1409 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC5	O00471	708 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC9	P31274	260 aa		30.27	■■■□□ 2.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		30.26	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RREB1	Q92766	1687 aa		30.25	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL1	A6NKG5	1358 aa		30.24	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	IL2RB	P14784	551 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	AMPH	P49418	695 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	30.2	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	30.18	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PLSCR1	O15162	318 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-205	ENST00000563200	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	INSR	P06213	1382 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FLT4	P35916	1363 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NHS	Q6T4R5	1651 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF4	Q96M43	638 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP5	O75197	1615 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNQ2	O43526	872 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PANK3	Q9H999	370 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MEGF6	O75095	1541 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PROM2	Q8N271	834 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF14	Q5TI25	921 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39

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