RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTCH1Q13635 1447 aa25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 HMOX1P09601 288 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSPYL6Q8N831 410 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KL1-216ENST00000557413 ALKQ9UM73 1620 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.76■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 GBP4Q96PP9 640 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 GNAI1P63096 354 aa25.74■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFT57Q9NWB7 429 aa25.74■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.73■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC4O15439 1325 aa25.73■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 RICTORQ6R327 1708 aa25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 MBIPQ9NS73 344 aa25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP7BP35670 1465 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLCN1P35523 988 aa25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF853P0CG23 659 aa25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 REREQ9P2R6 1566 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTMSP20962 102 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 IL13P35225 146 aa25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDC45O75419 566 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFAP44Q96MT7 982 aa25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.64■■□□□ 1.7
RPS6KL1-216ENST00000557413 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 DLC1Q96QB1 1528 aa25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 NME9Q86XW9 330 aa25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 SSFA2P28290 1259 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM83GA6ND36 823 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.58■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 ESPNB1AK53 854 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCTPP1Q9H773 170 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCTN1Q14203 1278 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTC22Q5TAA0 569 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 RABEP1Q15276 862 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 AK9Q5TCS8 1911 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERBB4Q15303 1308 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 COG3Q96JB2 828 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP26Q9BXU7 913 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP10DQ9P241 1426 aa25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 CPS1P31327 1500 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGS12O14924 1447 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUCB2P80303 420 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP85Q6P2H3 762 aa25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms