RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.09■■□□□ 1.93
PRDM4-205ENST00000550376 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.06■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 ABTB2Q8N961 1025 aa27.06■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.04■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 PDE3AQ14432 1141 aa27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 USP31Q70CQ4 1352 aa27.03■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 AMPHP49418 695 aa27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PRDM4-205ENST00000550376 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 ORAI2Q96SN7 254 aa27.01■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 PEAK1Q9H792 1746 aa27■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 IL16Q14005 1332 aa27■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 IGHDP01880 384 aa26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.98■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 TSPYL6Q8N831 410 aa26.98■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 FOXO3O43524 673 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 HSPA2P54652 639 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 PSME1Q06323 249 aa26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 MCM10Q7L590 875 aa26.96■■□□□ 1.91
PRDM4-205ENST00000550376 MBIPQ9NS73 344 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.95■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 PIK3C2AO00443 1686 aa26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 EYA1Q99502 592 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM27P14373 513 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 FLT4P35916 1363 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 SBNO1A3KN83 1393 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 HOXC9P31274 260 aa26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 RGS3P49796 1198 aa26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-205ENST00000550376 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.89■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF853P0CG23 659 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 GNAI1P63096 354 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 KRT24Q2M2I5 525 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 IFT57Q9NWB7 429 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 MSH5O43196 834 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 VAMP4O75379 141 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 CFAP44Q96MT7 982 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 PDE4AP27815 886 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.79■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF10O15013 1369 aa26.79■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 BACH2Q9BYV9 841 aa26.78■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.77■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.77■■□□□ 1.88
PRDM4-205ENST00000550376 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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PRDM4-205ENST00000550376 MS4A1P11836 297 aa26.76■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.75■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 KIF16BQ96L93 1317 aa26.74■■□□□ 1.87
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PRDM4-205ENST00000550376 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM94Q12767 1356 aa26.74■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 CHL1O00533 1208 aa26.73■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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PRDM4-205ENST00000550376 NBPF4Q96M43 638 aa26.73■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 KDRP35968 1356 aa26.73■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 GCP02774 474 aa26.72■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 IP6K1Q92551 441 aa26.71■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 ATF3P18847 181 aa26.71■■□□□ 1.87
PRDM4-205ENST00000550376 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.69■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.69■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.68■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 CRB1P82279 1406 aa26.67■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.67■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PRDM4-205ENST00000550376 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.66■■□□□ 1.86
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