RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.21■■■■□ 3.07
ACER3-211ENST00000531461 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
ACER3-211ENST00000531461 RGPD5Q99666 1765 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 NFAT5O94916 1531 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 ABCC6O95255 1503 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 USP54Q70EL1 1684 aa34.19■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.18■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.18■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 SBF2Q86WG5 1849 aa34.17■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 USP31Q70CQ4 1352 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 DDB1Q16531 1140 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.14■■■■□ 3.06
ACER3-211ENST00000531461 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.13■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 TONSLQ96HA7 1378 aa34.12■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 BCL9O00512 1426 aa34.11■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
ACER3-211ENST00000531461 NBPF14Q5TI25 921 aa34.07■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 SOX12O15370 315 aa34.06■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 PLSCR1O15162 318 aa34.05■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 CCDC7Q96M83 1385 aa34.04■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.03■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 LTN1O94822 1766 aa34.01■■■■□ 3.04
ACER3-211ENST00000531461 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.01■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 NME9Q86XW9 330 aa34■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 TMC1Q8TDI8 760 aa34■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.99■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 ERBB3P21860 1342 aa33.97■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PP64 1363 aa33.97■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 NINLQ9Y2I6 1382 aa33.96■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 EXOC5O00471 708 aa33.95■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 SLC24A1O60721 1099 aa33.95■■■■□ 3.03
ACER3-211ENST00000531461 TESK2Q96S53 571 aa33.94■■■■□ 3.02
ACER3-211ENST00000531461 TNS2Q63HR2 1409 aa33.94■■■■□ 3.02
ACER3-211ENST00000531461 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.91■■■■□ 3.02
ACER3-211ENST00000531461 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.88■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 PROM2Q8N271 834 aa33.86■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.85■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 NHSQ6T4R5 1651 aa33.84■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.84■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 SPON1Q9HCB6 807 aa33.84■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 IL2RBP14784 551 aa33.83■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
ACER3-211ENST00000531461 KCNQ2O43526 872 aa33.82■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 CASZ1Q86V15 1759 aa33.82■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 IP6K1Q92551 441 aa33.8■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 TXNRD1Q16881 649 aa33.78■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.76■■■■□ 3
ACER3-211ENST00000531461 COG3Q96JB2 828 aa33.75■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.7■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 BTAF1O14981 1849 aa33.7■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 TMF1P82094 1093 aa33.7■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.7■■■□□ 2.99
ACER3-211ENST00000531461 USP47Q96K76 1375 aa33.7■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 STK32BQ9NY57 414 aa33.69■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 SLC15A2Q16348 729 aa33.68■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 HOXC9P31274 260 aa33.67■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.67■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 PAPPAQ13219 1627 aa33.65■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 RTL1A6NKG5 1358 aa33.65■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
ACER3-211ENST00000531461 AMPHP49418 695 aa33.63■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 FYB1O15117 783 aa33.62■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 CDCA8Q53HL2 280 aa33.62■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.62■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.6■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 FBLN1P23142 703 aa33.59■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB7AO95365 584 aa33.58■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 PTGER2P43116 358 aa33.58■■■□□ 2.97
ACER3-211ENST00000531461 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.57■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.57■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 MYOM1P52179 1685 aa33.55■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 MTFR1LQ9H019 292 aa33.55■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.54■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 MEGF6O75095 1541 aa33.53■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 KIF24Q5T7B8 1368 aa33.52■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 CGNL1Q0VF96 1302 aa33.52■■■□□ 2.96
ACER3-211ENST00000531461 DCAF8L1A6NGE4 600 aa33.51■■■□□ 2.95
ACER3-211ENST00000531461 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.51■■■□□ 2.95
ACER3-211ENST00000531461 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
ACER3-211ENST00000531461 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.51■■■□□ 2.95
ACER3-211ENST00000531461 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
ACER3-211ENST00000531461 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms