RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517100.1

RNU6-201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-201P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-201P-201ENST00000517100 GRM5P41594 1212 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 SKIP12755 728 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 FSHRP23945 695 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 RNF135Q8IUD6 432 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDK15Q96Q40 435 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-201P-201ENST00000517100 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 ESPNB1AK53 854 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CYP4X1Q8N118 509 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 NR3C2P08235 984 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 ADH1CP00326 375 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDCA8Q53HL2 280 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PLPP7Q8NBV4 271 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 WASF2Q9Y6W5 498 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 ATP9BO43861 1147 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 RGS20O76081 388 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 SMPD1P17405 629 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 MPNDQ8N594 471 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF592Q92610 1267 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP17L5A8MUK1 530 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRR20EP86478 221 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRR20CP86479 221 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRR20DP86480 221 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRR20BP86481 221 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRR20AP86496 221 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 NNTQ13423 1086 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 SCTRP47872 440 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 NR5A1Q13285 461 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 NCOA4Q13772 614 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 RNF20Q5VTR2 975 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 HPS1Q92902 700 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP17L3A6NCW0 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP17L4A6NCW7 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 CYLDQ9NQC7 956 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 FAM187AA6NFU0 413 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 GFRA3O60609 400 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 CBLBQ13191 982 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 EML3Q32P44 896 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ITPKCQ96DU7 683 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 LILRA1O75019 489 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 TIMP2P16035 220 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 ERVK-9P63128 1117 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 MYT1Q01538 1121 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 CLDN10P78369 228 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 USP4Q13107 963 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-201P-201ENST00000517100 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms