RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABL1P00519 1130 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 JUNDP17535 347 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAPK1P28482 360 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SIX5Q8N196 739 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBXN4Q92575 508 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 H3BRB1 525 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGAP33O14559 1287 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 C21orf2O43822 256 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NR1I2O75469 434 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASB16Q96NS5 453 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PBX2P40425 430 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 BRICD5Q6PL45 260 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB33Q86T24 672 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRCH3Q96II8 777 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 GTF2IP78347 998 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSME1Q06323 249 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNH2Q12809 1159 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP4Q13107 963 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC102BQ68D86 513 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 COL26A1Q96A83 441 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLAIN2Q9P270 581 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 M0R2N6 131 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRMT3O60678 531 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM13AO94988 1023 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLDN10P78369 228 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSS51Q4VC12 460 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 HINFPQ9BQA5 517 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAP10Q9P2G4 905 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 OCLNQ16625 522 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM32Q8TC27 787 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CITED4Q96RK1 184 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NDUFB5O43674 189 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP4CP60510 307 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPATA32Q96LK8 384 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRS2Q9HD23 443 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 RECKO95980 971 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSEN2P49810 448 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 TK2O00142 265 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXO3O43524 673 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 DXOO77932 396 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 DKK1O94907 266 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 WEE1P30291 646 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms